输出的结果文件都在aligned目录下,其中"merged_nodups.txt"就是下一步3D-DNA的输入文件之一。 3. 运行3d-dna 3d-dna的运行也没有多少参数可以调整,如果对组装基因组质量的信心高,就用-r 0, 否则用默认的-r 2就行了。 ~/soft/3d-dna/run-asm-pipeline.sh-r2reference/genome.fa aligned/merged_nodups.t...
Eigenvector: 确定分隔 juicer工作流程 之后Juicer的输出结果给3D-DNA,分析流程见下图。3D-DNA先根据Hi-C数据分析contig中的misjoin,对其进行纠错。之后通过四步,分别是Polish, Split, Seal和Merge, 得到最终的基因组序列 3d-dna流程 软件安装 在安装之前,确保服务器上有了下面这些依赖软件工具 LastZ(仅在杂合基因组...
使用3D-DNA做基因组组装的整体流程如下图,分别为组装,Juicer分析Hi-C数据,3D-DNA进行scaffolding,使用JBAT对组装结果进行手工纠正,最终得到准染色体水平的基因组。 总体流程 基因组组装可以是二代测序方法,也可以是三代测序组装方法,总之会得到contig。 Juicer的工作流程见下图,输入原始的fastq文件,处理得到中间文件.hic...
B、水稻基因组文库中的每个重组DNA只含有部分水稻基因,故B错误; C、cDNA文库时用逆转录法形成的,即以mRNA为模板逆转录形成的DNA,这样可以研究某个基因在不同组织中的表达情况,故C正确; D、小鼠肝脏细胞能合成过氧化氢酶,因此肝脏细胞含有相应的mRNA,所以能从小鼠肝脏细胞的cDNA文库中获取过氧化氢酶基因,故D正确...
下列属于获取目的基因方法的是①利用mRNA反转录形成 ②从基因组文库中提取 ③从受体细胞中提取④利用PCR技术 ⑤利用DNA转录 ⑥人工合成 A.①②③⑤B.①②⑤⑥C.①②③④D.①②④⑥
真核生物可以通过多种方法,来有效利用基因组信息,利用较少的DNA序列编码出较多种类的蛋白质。以下哪个不是真核生物用来有效利用基因组的方法( )A.可变剪接B.重叠基因C.可变多聚腺苷化D.利用不同的启动子序列的答案是什么.用刷刷题APP,拍照搜索答疑.刷刷题(shuashuati.co
1.基因组原位杂交(GISH)技术是鉴别和验证异源多倍体的基 因组组成,分析异源多倍体基因组的起源和进化,以及不同基因组相互关系的简便而十分有效的工具.以地高辛标记的栽培稻(基因组为AA)基因组DNA为探 针,对非洲野生稻(基因组为BBCC)的体细胞染色体进行荧光原位杂交分析,研究AA染色体组和BBCC染色体组之间的关系.同时...
综上所述,研究团队提出了基于HiFi测序技术的5mC检测方法ccsmeth以及单倍型甲基化检测流程ccsmethphase。在不同数据集上的测试结果表明,所提出方法可在单倍型、单分子、单碱基水平准确检测DNA 5mC。该成果证明HiFi测序技术可准确检测DNA 5mC...
1.回答下列有关问题:(1)利用PCR技术扩增目的基因的前提.是要有一段已知目的基因的核苷酸序列.以便根据这一序列合成引物.(2)目的基因进入受体细胞内.并且在受体细胞内维持稳定和表达的过程.称为转化.(3)要检测转基因生物的DNA上是否插入了目的基因.其方法是采用DNA分子杂
利用限制性内切酶法切割基因组DNA,即可分离纯化目的基因 A. 正确 B. 错误 题目标签:可分离性内切酶限制性内切酶如何将EXCEL生成题库手机刷题 如何制作自己的在线小题库 > 手机使用 分享 反馈 收藏 举报 参考答案: B 复制 纠错 举一反三 以下关于对第五套人民币票面特征描述正确的有()。 A. 100...