如下显示是smina软件所有可用的参数。参数很多,但并不是每个都非常常用,一般特殊分子对接情况下用到再尝试即可。这里对非常常用的一些参数进行简要介绍。-r 是必须的受体蛋白pdbqt文件,-l 是必须的配体小分子pdbqt文件,-o 是必须的输出对接结果小分子构象文件,--seed 可以指定随机种子保证结果的可重复性,--exhaustiven...
autodock分子对接所使用的软件包括：autodock，openbabel，pymol 以下关于几个软件的安装步骤及遇到问题的解决办法：1.软件的下载：1)autodock下载：打开autodock官网，https://autodock.scripps.edu/分别下载两个软件autodock 和autodck tools 注意安装路径，之后会用到，建议使用默认路径不要随意更改 一般都是安装在...
安装的pymol在C:\ProgramData\anaconda3\Scripts这目录下面,可以自己找,bat直接创建一个快捷方式,直接放在桌面上就行 直接在cmd中输入conda --version,就可以出来conda的信息,在此,直接在cmd中输入pymol也可以进行使用软件了 还有一个MGLTOOLS软件的安装,这个软件也是很神奇,在官网上下载软件包之后,出现一直安装不上...
【分子对接】简易攻略 · 3篇 一、软件安装 1.AutoDock(https://autodock.scripps.edu/) 2.AutoDockTools(https://ccsb.scripps.edu/mgltools/) 3.Python(https://www.python.org/downloads/) 4.Python Extension Packages(https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/) 5.Open Babel(https://openbab...
3️⃣ 安装MGLTools:双击文件夹中的.exe文件进行安装,完成后在桌面上会出现四个图标。4️⃣ 复制文件:打开autoduck文件夹中的4.2.6文件夹(版本号可能会变化),将两个.exe文件复制到autoduck文件夹中。5️⃣ 设置工作路径:打开桌面上的图标,按照提示设置工作路径。6️⃣ 放置PDB文件:将需要对接的...
分子对接软件AutoDock和Pymol安装使用笔记(通用教程) 本教程针对初学分子对接的科研小白,对于如何安装AutoDock和Pymol及过程中可能出现的问题进行有限范围内的总结和梳理,欢迎沟通交流
经过多次尝试,我终于成功安装了DS分子对接软件!🎉🎉🎉 在此过程中,我总结了一些关键步骤和注意事项,希望能帮助到大家:1️⃣ 首先,确保退出所有安全软件,如360管家防火墙,以避免安装过程中的拦截问题。 2️⃣ 在开始安装之前,如果之前有未成功安装的版本,记得从控制面板中彻底卸载DS2016、2017、2018等版本...
一:Autodock4和MGLTools的下载和安装 Autodock4安装 官网:https://autodock.scripps.edu/download-autodock4/ image.png MGLTools安装 官网:https://ccsb.scripps.edu/mgltools/downloads/ image.png 二:python2.5的下载和配置 官网:https://www.python.org/downloads/windows/ ...
分子对接教程 | (1) 软件安装准备 本人自己的一个小课题需要分子对接,这里在做的时候顺便写一下教程。 AutoDock 网站下载地址:http://autodock.scripps.edu/ 进入网站首页点击downloads,进入下载页面,需要从这里下载2个软件,AutoDock 4.2和mgltools。 AutoDock 4.2的下载:右键proceed to download page,在新窗口中...
1. 解压缩 2. 双击解压后的安装文件，选择语言为英语 3.安装完成后，自动弹出两个对话框。。