按照http://www.bevanlab.biochem.vt.e ... la/07_analysis.html教程进行了拉伸分子动力学，但是自己...
本研究着力于离子液体在水中的平均力位能(PotentialofMeanForce,简称PMF),辅以局部微观结构的分析,通过在模拟中有目的的改变势能函数研究其对平均力位能的影响。首先,我们以甲烷分子对在水中PMF的分子动力学模拟为例,用伞形抽样(UmbrellaS锄pling)和WHAM(Wei出edHistogr锄AnalysisMethod)方法计算其平均力位能,并对计算...
首先,我们以甲烷分子对在水中PMF的分子动力学模拟为例,用伞形抽样(Umbrella Sampling)和WHAM (Weighted Histogram Analysis Method)方法计算其平均力位能,并对计算细节和参数优化进行探讨.其次,研究了NaCl在水中的PMF,同时分析了用于表征局部微观结构的径向分布函数;此外,通过在模拟中改变离子的电荷,发现势能函数对PMF以及...
最近在学拉伸动力学，可以好疑惑，什么都看不懂 发自小木虫Android客户端