分子动力学模拟技术(Molecular Dynamics Simulation,MDS)是一种依靠计算机模拟分子、原子体系运动的多体模拟方法,基于牛顿运动定律和量子力学原理,通过统计计算得到体系的各种性质和行为。 分子动力学模拟技术名词解释 分子动力学模拟技术的基本定义 分子动力学模拟技术(Molecular Dynami...
分子动力学模拟(Molecular Dynamics Simulation,简称MD)用于研究分子和原子在特定条件下的运动行为。通过在一定的时间步长内数值解分子的牛顿运动方程,MD模拟可以模拟分子系统在不同的温度、压力和其他外部条件下的动态行为。 基本原理:MD模拟基于经典力学原理,主要步骤包括: 定义系统:将研究对象抽象为由N个相互作用的粒子...
分子动力学模拟(Molecular Dynamics Simulation,简称MD)用于研究分子和原子在特定条件下的运动行为。通过在一定的时间步长内数值解分子的牛顿运动方程,MD模拟可以模拟分子系统在不同的温度、压力和其他外部条件下的动态行为。 基本原理:MD模拟基于经典力学原理,主要步骤包括: 定义系统:将研究对象抽象为由N个相互作用的粒子...
[5] Xue W, Jin X, Ning L, Wang M, Liu H, Yao X. Exploring the molecular mechanism of cross-resistance to HIV-1 integrase strand transfer inhibitors by molecular dynamics simulation and residue interaction network analysis. J Chem Inf Model. 2013 Jan 28;53(1):210-22.
🔬 分子动力学模拟是什么?分子动力学模拟(Molecular Dynamics Simulation,简称MD)是一种研究分子和原子在特定条件下的运动行为的方法。通过在一定的时间步长内数值解分子的牛顿运动方程,MD模拟可以模拟分子系统在不同的温度、压力和其他外部条件下的动态行为。🧩...
分子动力学模拟(Molecular Dynamics, MD)是一种基于经典力学的计算方法,通过数值求解牛顿运动方程来预测分子系统中粒子(如原子和分子)的运动。 分子动力学模拟使用势能函数来描述分子间的相互作用,模拟它们在一定时间内的运动轨迹和行为。这种方法可以提供关于分子运动、能量和动力学性质的微观细节,广泛应用于物理、化学、...
分子对接(Molecular docking)与分子动力学模拟(Molecular dynamics simulation)是计算生物学中重要的一部分,在生物学研究中不断发挥着重要的作用。分子对接与分子动力学技术可以深入地阐述分子间的相互作用,并可以形象地解释相互作用的机理,特别是在药物开发中有着重要的应用,目前已经成为阐述生物学机理的重要研究方法。分子...
拉伸分子动力学模拟(又叫受控分子动力学模拟,Steered Molecular Dynamics simulation, SMD)是MD的一种变体,它特别关注分子在外力作用下的反应,例如通过施加外部力来模拟分子被拉伸的过程。SMD模拟与单分子力谱(SMFS)实验相似,后者是一种实验技术,用于直...
分子对接(Molecular docking)与分子动力学模拟(Molecular dynamics simulation)是计算生物学中重要的一部分,在生物学研究中不断发挥着重要的作用。分子对接与分子动力学技术可以深入地阐述分子间的相互作用,并可以形象地解释相互作用的机理,特别是在药物开发中有着重要的应用,目前已经成为阐述生物学机理的重要研究方法。分子...
分子对接(Molecular docking)与分子动力学模拟(Molecular dynamics simulation)是计算生物学中重要的一部分,在生物学研究中不断发挥着重要的作用。分子对接与分子动力学技术可以深入地阐述分子间的相互作用,并可以形象地解释相互作用的机理,特别是在药物开发中有着重要的应用,目前已经成为阐述生物学机理的重要研究方法。分子...