MedeA LAMMPS模块可以用于分子动力学模拟。本算例基于PCFF+力场,对甲醇体系进行分子动力学模拟,从规整排列的初始结构出发,得到平衡态。, 视频播放量 267、弹幕量 0、点赞数 3、投硬币枚数 0、收藏人数 10、转发人数 4, 视频作者 源资科技, 作者简介 计算模拟:材料科学、
Gromacs分子动力学模拟教学视频·第二节共计5条视频,包括:MD的定义、MD的质量控制、MD的结果参数解读等,UP主更多精彩视频,请关注UP账号。
Gromacs分子动力学模拟教学视频·第三节·水中的溶菌酶 7548播放 Autodock Vina分子对接完整步骤 24.0万播放 分子对接 - 打分函数的评价和比较 +所用基准数据集 7882播放 利用分子对接结果在Gromacs上进行分子动力学模拟 2.5万播放 gromcas蛋白质复合物--配体的拓扑——2 ...
进行分子动力学模拟的第一步是确定起始构型,一个能量较低的起始构型是进行分子模拟的基础,一般分子的其实构型主要是来自实验数据或量子化学计算。在确定起始构型之后要赋予构成分子的各个原子速度,这一速度是根据玻尔兹曼分布随机生成,由于速度的分布符合玻尔兹曼统计,因此在这个阶段,体系的温度是恒定的。另外,在随机生成各...
本课程主要内容包括分子动力学概述,分子动力学理论框架的搭建,蒙特卡洛模拟、分子动力学模拟的方法原理与常用技术。 课程简介(英文): Molecular dynamics simulation describesmolecular systemswiththeclassical mechanics. With the help ofcomputer technology, scientists can simulateconformation, energy, and other ...
分子动力学模拟基础教学5-1 常见力场介绍(选择力场的原则) - 奥然科技于20220307发布在抖音,已经收获了348个喜欢,来抖音,记录美好生活!
1、分子动力学模拟分子动力学模拟分子动力学是一门结合物理,数学和化学的综合技术。分子动力学是一套分子模拟方法,该方法主要是依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动,以在由分子体系的不同状态构成的系统中抽取样本,从而计算体系的构型积分,并以构型积 分的结果为基础进一步计算体系的热力学量和其他宏观性质。这门技术的...
内容摘要:分子动力学模拟的理论基本,为对应于r 值下的分子的势能;r 为原子间距;ε,第32卷1期,年1月 安徽师范大学学报(自然科学版,根据计算结果再算出粒子的速度与位置,分子动力学模拟的应用,安徽师范大学学报(自然科学版)2009年,参考文献,曹莉霞,安徽师范大学学报(自然科学版)2009年,周宗荣,丁丽.. 文档格式:...
📚 分子对接与动力学模拟在线教学,涵盖各种体系,提供高清对接结果图、分子动力学模拟及MD结果分析图。🔬 计算服务:包括各种体系的分子对接,提供高清对接结果图、分子动力学模拟及MD结果分析图。结合自由能计算,涵盖氨基酸残基能量分解、ADMET预测、药效团、虚拟筛选(可指定或提供虚筛数据库)。💻...
分子动力学模拟;原子间相互作用势;有限差分算法...2COO-和1...18参考文献:...