全基因组de novo测序介绍 基因组从头测序(de novo sequencing),主要针对基因组序列未知或参考基因组组装不理想的物种,构建不同类型的基因组DNA文库,并进行序列测定。然后使用生物信息学方法对序列进行拼接、组装和注释,从而绘制该物种完整的基因组序列信息。简单基因组:重复序列低于50%,且二倍体杂合度低于0.5%的物种...
北京诺禾致源科技股份有限公司,提供全基因组de novo Nanopore 辅助组装注释Pacbio sequel II测序技术知识分享和全基因组de novo Nanopore 辅助组装注释Pacbio sequel II测序服务,专注于生命科学与研究、肿瘤临床治疗建议、以及人类遗传领域,致力于成为全球领先的基因组学
全基因组de novo产品介绍从头测序即denovo测序, 不需要任何参考序列资料即可对某个物种进行测序,用生物信息学分析方法进行拼接、组装,从而获得该物种的基因组序列图谱。利用全基因组从头测序技术,可以获得动植物的全基因组序列,带动这个物种下游一系列研究的开展,从而推进该物种的研究。全基因组序列图谱完成后,可以构建...
全基因组从头测序(de novo测序)
建库试剂盒 三代测序仪：Pacbio RSⅡ 或 Pacbio Sequel 组装分析软件：Falcon 方法/步骤 1 一、技术路线 2 二、生物信息分析1. 原始数据质量评估 2. 基因组组装 3. 基因组注释 4. 进化分析 5. 重测序或转录组联合分析 3 三、结果展示 1.软件使用 FALCON HGAP（Hierachical Genome Ass...
华大科技官网http://www.bgitechsolutions.cn/提供全基因组从头测序(de novo测序)常见测序问题解答。 全基因组从头测序 1.如何保证组装的准确性? 答:通过构建不同长度的插入片段文库,并采用双末端测序以保证组装的准确性。 2.植物基因组测序对样品取样有什么特殊要求? 答:要求对黑暗无菌条件下培养的黄化苗或组培样...
高通量测序:效率高,成本低;高深度测序:准确率高;全球领先的基因组组装软件:采用华大基因研究院自主研发的SOAPdenovo软件;经验丰富:华大科技已经成功完成上百个物种的全基因组从头测序。 研究内容:基因组组装■K-mer分析以及基因组大小估计;■基因组杂合模拟(出现杂合时使用);■初步组装;■GC-Depth分布分析;■测序深...
基因组从头测序(de novosequencing):在不依赖参考基因组的情况下对某物种进行基因组测序及拼接组装,从而绘制该物种的全基因组序列图谱。 根据基因组的复杂程度,基因组可分为:简单基因组和复杂基因组。 简单基因组:主要指重复序列比例低于50%的单倍体或高纯合二倍体(其中二倍体的杂合率低于0.5%),如大部分的哺乳类...
以基因组大小5Mb的细菌为例，测序1个SMRT Cell即可获得160多*的覆盖度。真菌基因组大小浮动范围相对较大。大多数在40Mb以内，建议采用Pacbio RS II平台测序测序4-8个cell，获得3.2Gb-8Gb的数据，进行全基因de novo拼接。以基因组大小为38Mb为例，测序8个SMRT Cell即可获得至少168*的覆盖度。三代平台的测序错误...
全基因组测序分为从头测序(de novo sequencing)和重测序(re-sequencing)。 从头测序(de novo)不需要任何参考基因组信息即可对某个物种的基因组进行测序,利用生物信息学分析方法进行拼接、组装,获得该物种的基因组序列图谱,从而推进该物种的后续研究。 基因组重测序是对有参考基因组物种的不同个体进行的基因组测序,并...