宏基因组测序也是一种快速检测和发现新物种的测序方法,其基因组数据来自同一物种,不是单一的菌株,不需要对微生物分离和纯化。已测序的宏基因组中包含许多未被鉴定的质粒序列,从宏基因组数据中组装质粒计算量大且费时、费力[24]。细菌病原体的WGS具有流行病学监测的潜力[25]。 2 WGS后质粒的组装 WGS后质粒的组装...
基因组读长质粒组装鉴定全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)从1977年发展至今,已成为一种快速,低成本获取生物体全基因组的方法[1].WGS可发现基因组变异,在微生物的分类鉴定中应用广泛[2].WGS经历了三代技术革新,二代测序和三代测序的结合已成为目前最广泛的杂交测序方法[3-4].杂交测序一方面使用长读长...
基因组读长质粒组装鉴定全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)从1977年发展至今,已成为一种快速,低成本获取生物体全基因组的方法[1].WGS可发现基因组变异,在微生物的分类鉴定中应用广泛[2].WGS经历了三代技术革新,二代测序和三代测序的结合已成为目前最广泛的杂交测序方法[3-4].杂交测序一方面使用长读长...