然后创建SingleCellExperiment对象;(2)对数据进行质控并去除可能会干扰下游分析的低质量细胞;(3)将原始计数转换为标准化的表达值,以消除细胞和基因特异性偏好;(4)进行特征选择筛选生物学相关基因进行下游分析;(5)应用降维方法压缩数据并降噪;(6)如果需要,整合多批次scRNA-seq数据。
使用featureCounts对bam文件进行定量。 ## 定义输入输出文件夹gtf=/home/zk/project/reference/annotateGTF/Homo_sapiens.GRCh38.101.gtf.gz inputdir=/media/zk/crlm/map outputdir=/media/zk/crlm/count# featureCounts对bam文件进行计数nohup featureCounts-T16-p-t exon-g gene_id-a$gtf-o all.id.txt$inputdi...
修饰的指导RNA,CRISPR-核糖核蛋白复合物和使用方法.pdf,本文描述了修饰的指导RNA,例如单指导RNA,其从5'至3'包括单链原间隔序列、Cas9多肽结合区的第一互补链、结合生物素结合分子的适体以及Cas9多肽结合区的第二互补链。还描述了RNP复合物,其包括修饰的指导RN
3.一种用于在宿主细胞中编辑靶RNA的方法,其包括将工程化gsnoRNA引入所述宿主细 胞内,其中所述gsnoRNA包含与所述靶RNA中包含靶尿苷残基的序列杂交的引导序列,其中 所述gsnoRNA包含选自以下的核苷酸序列:SEQ ID NO:4‑6、9‑12、15‑19、22‑36和177‑179, 且其中所述gsnoRNA在所述宿主细胞中募集DKC1...
本发明相关方面包括重组DNA构建体和用于抑制内源miRNA诱骗序列的方法。也公开了识别并结合其它小RNA(ta-siRNA、nat_siRNA和定相小RNA)但不被切割、因而降低小RNA活性的类似诱骗序列。本发明的其它具体实施方案在以下发明详述中公开。附图简述W010]图1描绘了选自以下植物miRNA前体序列的折回结构的非限制性实例SEQIDNO...