这个打印和保存频率设置在上述训练参数中,"disp_freq":1000,"save_freq":10000,可以根据自己习惯进行修改。同时,训练和测试误差显示在文件 lcurve.out 中,打开lcurve.out文件我们可以看到如下信息: 从上图中可以看到,lcurve.out文件一共包含8列,从左到右每一列分别代表:训练步长、验证损失、训练损失、能量的训练...
首先,数据准备阶段,包括数据下载和格式转换。数据集通常来源于VASP的AIMD模拟结果,解压后会得到多个文件夹,其中包含特定帧数的OUTCAR格式数据。接下来,利用dpdata工具进行数据格式转换,将原始OUTCAR格式数据转换为DeePMD-kit可读的压缩格式,生成训练和验证数据集。其次,模型训练阶段。配置文件是训练的核心...
构建酸与128个水分子的体系,用DFTB2模拟得到一系列结构,并用 BLYP-D3/TZV2P 重新计算,得到初始训练集。接着,受到DP-GEN[3]的启发,通过同步学习流程迭代生成模型,其中训练步用DeePMD-kit[2]训练DP模型,探索步LAMMPS+DeePMD-kit+PLUMED进行伞形采样模拟,标签步用CP2K计算能量和力。用最终的模型计算自由能。 (2)...
二、使用DeepMD-kit先安装dpdata。使用`script.py`脚本(源自dpdata的GitHub)转化OUTCAR文件,并生成deepmd训练集。运行`python script.py`后,将得到深md文件夹,内含训练集,具体格式请查阅官方文档。读取训练集文件,转换为POSCAR格式。使用指定的input文件,确保训练集与input文件无误,通常会输出`train....