华东理工大学教授、酶工程领域专家许建和表示,这一人工智能的研究成果是有里程碑意义的,其核心内容成功构建了一种基于深度学习的方法(DLKcat),可以从酶的序列和底物结构出发预测 kcat,并可用于重构酶容量约束型基因组规模代谢模型,特别适用于表征酵母和真菌细胞的代谢过程。 1 秒钟筛选 100 个酶 值得注意的是,上述 ...
[0007] 本发明提供一种基于调控-代谢网络整合模型预测微生物生长表型的方法,具体 步骤如下:[0008] (1)首先构建基因调控网络,基于大量基因表达谱数据,用线性回归推断每个 目标基因随转录因子表达变化的线性方程,然后随机抽取部分表达谱数据进行若干次 bootstrap线性回归,根据转录因子和目标基因的调控关系在这若干个线性...
1.一种基于基因组尺度代谢网络模型的代谢工程设计预测方法,其特征在于,包括如下步骤: 1)分别获取目的菌湿实验数据和高质量基因组尺度代谢网络模型; 2)根据湿实验数据进行模拟条件设定; 3)模拟实验菌的生长状态,获得模拟实验菌的代谢通量分布,以及模拟优化工程菌的生长状态,获得与实验菌同样培养条件下模拟优化工程菌的...
摘要 本发明公开了一种基于调控‑代谢网络整合模型预测微生物生长表型的方法。该方法首先构建基因调控网络,基于大量基因表达谱数据,运行多次线性回归推断每个目标基因随转录因子表达变化的线性方程,计算错误发现率FDR;然后取FDR<=0.05的调控关系作为全局的调控网络,找出调控网络中调控代谢基因的转录因子,根据转录因子的类型...
基于基因组尺度代谢网络模型的代谢工程设计预测方法专利信息由爱企查专利频道提供,基于基因组尺度代谢网络模型的代谢工程设计预测方法说明:一种基于基因组尺度代谢网络模型的代谢工程设计预测方法分别获取目的菌湿实验数据和高质量基因组尺度...专利查询请上爱企查