The Golm Metabolome Database (GMD)是由德国Max Planck研究所的科学家建⽴的植物代谢组学数据库，包含1450种已被鉴定的代谢物和10336个相关质谱图。该库资源侧重于⽓质⾮靶向代谢组学，其最⼤特点是含有⼤量的植物代谢物的GC-MS图谱（特别是衍⽣化后的）。⽤户可以导⼊⾃⼰的GC-MS数据进⾏...
代谢组学数据库 /metabonomic database/ 最后更新2023-11-24 浏览87次 包括代谢组学所研究的内源性小分子定性和定量信息,以及与上下游代谢、代谢通路相关的信息与数据。 英文名称 metabonomic database 所属学科 现代医学
当前,代谢组学研究中涉及到的数据库大致可划分为两个层次:存储原始检测数据的原始数据库和存储代谢物及代谢通路相关信息的代谢物库。产生最早且发展相对成熟的是代谢物库。早期的代谢物库主要是存储各种代谢物的基本信息,包括代谢产物的简介、化学式、分子量、化学分类、化学性质、所在的代谢通路和质谱图等。用户可以将...
HMDB (人类代谢组数据库)收录了很多代谢组的数据,用于代谢组学、临床化学、生物标志物开啊和基本教育等。数据联通化学、临床、分子生物学3个层次,共有114,099个代谢物。 网站提供了多种浏览和查询功能,可以关注不同的疾病、通路、BMI、年龄、性别相关代谢组学。 下图展示的是BMI相关代谢物的数据。 如果我们想把这...
The Golm Metabolome Database (GMD) 数据库是由德国Max Planck的科学家建立的植物代谢组学数据库,侧重于非靶向代谢组学,该数据库的最大特点是含有大量的植物代谢产物的GC-MS 图谱(特别是衍生化后的),用户可以导入自己GC-MS 数据进行搜索比对和鉴定。另外,该数据库还含有...
1.负责搭建并维护代谢组学相关实验数据库和基础信息库等系统 2.根据项目需求开发代谢组学相关的软件、工具类应用及脚本 3.与数据分析团队配合完成数据分析工作 4.编写相关技术文档资料,为后续项目研发提供支持 5.其他领导安排的工作 登录后查看全部 代谢组学数据库工程师岗位薪资分布 ...
经过近半年的研发、测试与验证,派森诺全新一代代谢组学数据库——PerSonalbio Next-Generation Metabolomics Database(简称PSNGM)现已正式上线启用。该代谢数据库采用创新型模式构建,不仅来源丰富、容量巨大,更重要的是包含了医学、动物、植物、微生物、肠道菌群及中药6大分类库,95%以上代谢物可实现RT假阳性过滤,该库的...
The Golm Metabolome Database (GMD)是由德国Max Planck研究所的科学家建立的植物代谢组学数据库,包含1450种已被鉴定的代谢物和10336个相关质谱图。该库资源侧重于气质非靶向代谢组学,其最大特点是含有大量的植物代谢物的GC-MS图谱(特别是衍生化后的)。用户可以导入自己的GC-MS数据进行搜索比对和鉴定。另外,该库...
代谢组学数据库的开发对于归纳总结这些大数据、提高数据的使用率、进行深层次的交叉分析以及揭示隐藏在大数据背后的生物学机理都有重要的作用。 当前,代谢组学研究中涉及到的数据库大致可划分为两个层次:存储原始检测数据的原始数据库和存储代谢物及代谢通路相关信息的代...
同分异构体的存在,使得化合物无法仅依靠精确分子量实现准确定性。我们以代谢组学研究最常用的HMDB数据库为例,该库共收录代谢物22w+,我们筛选50-1,500分子量范围的共200,798条进行统计,发现仅有6%的化合物不存在同分异构体,53%的化合物同分异构体达到100以上,非常惊人的数字。