ChIP-seq是染色质免疫沉淀测序的缩写。从根本上说,ChIP-seq 是对与正在研究的 DNA 结合蛋白共沉淀的基因组 DNA 片段进行测序。以这种方式最常研究的 DNA 结合蛋白是转录因子(例如,p53 或 NFκB)、染色质修饰酶(例如,p300、组蛋白去乙酰化酶)、与基因组 DNA 相互作用的修饰组蛋白(例如,组蛋白 3 三甲基化赖氨...
ChIP指染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP),seq 指的是二代测序,那么ChIP-seq实际上也就是染色质免疫共沉淀+二代测序的一个过程。ChIP用来确定蛋白质与DNA相互作用情况,所以目前的ChIP-Seq 研究主要包括两大类应用——TF ChIP和Histone ChIP: ChIP-seq的原理流程: 1、Crosslinking:使用甲醛将目...
Chip-Seq技术定义:是一种高通量的生物学研究方法,用于研究基因组中特定区域的转录情况。它通过结合基因芯片和大规模测序技术,实现对基因表达水平的大规模并行分析。这种技术特别适用于研究基因表达调控、转录因子结合位点以及基因变异对表达的影响等领域。详细解释:首先,我们需要了解Chip-Seq的核心技术构成。
ChIP-seq是将染色质免疫沉淀技术(ChIP)与新一代测序技术(NGS)相结合[1],能够高效地在全基因组...
一、CHIP-seq的主要研究方向 ChIP-seq技术能够提供更高的分辨率、更少的噪音和更大的覆盖范围,然而其...
染色质免疫沉淀技术(Chromatin immunoprecipitation assay, ChIP)是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法,主要包括ChIP-qPCR和ChIP-seq两种;其中ChIP-qPCR用来验证与目标蛋白结合的已知DNA片段,ChIP-seq用来筛选与目标蛋白结合的未知DNA片段。背景说明 真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在。因此,研究蛋白质与...
Chip-seq,即染色质免疫沉淀-测序(Chromatin Immunoprecipitation-sequencing)技术,是一种强大的生物研究手段,用于解析细胞内蛋白质与DNA之间的相互作用。它结合了ChIP技术,专注于转录因子结合位点和特定DNA修饰位点的研究,尤其是在基因组层面。其工作原理是首先通过ChIP技术富集目标蛋白结合的DNA片段,通过...
CHIPseq是一种用于研究基因组与蛋白质之间相互作用的生物信息学分析方法。通过将免疫沉淀技术与高通量测序相结合,CHIPseq能够检测到蛋白质与DNA之间的相互作用,从而揭示基因组中潜在的调控机制。CHIPseq9是CHIPseq的一个变种,使用了更为灵敏的第九代测序技术,能够在更短的时间内产生更高质量的数据。二、CHIPseq9数据...