2. GATK-HaplotypeCaller的变异检测的基本原理 3.1. 安装 3.2. 使用说明 4. GATK-HaplotypeCaller实战 4.1 数据下载 4.2 运行命令 4.3 输出结果 References 要点1. GATK-HaplotypeCaller简介2. GATK-HaplotypeCaller的基本组装原理3. GATK-HaplotypeCaller的安装和使用4. GATK-HaplotypeCaller实战 hello,大家好,今天为...
HaplotypeCaller 能够从头组装变异活跃的区域(active region)并进行 SNP/INDEL检测。即每当程序遇到显示出变异迹象的区域时,它就会丢弃现有的比对信息并完全重新组装该区域中的reads。因此 HaplotypeCaller 在一些传统方法难以检测的区域上会更加准确,也使得在检测 indel 方面比 UnifiedGenotyper(gatk旧版变异检测模块) 等基于...