首先设置工作路径,点击Session->Set Working Directory->Choose Directory设置工作目录到length.txt文件所在的文件夹。 然后将barplot.R复制到Rstudio中运行。 #读取数据data=read.table("length.txt",sep="\t",header=F,row.names=1)data=as.data.frame(t(data))head(data)#查看读取的数据内容前几行 #...
比对之后我们会得到bam文件,画图所需的插入片段长度就需要从bam文件中提取,需要注意,这里的插入片段是文库中adapter之间的插入片段,即fragment, 需要和insert size区别开来。 1.自己构建长度文件+R脚本 对于单端测序而言,只有bam文件是不够的,需要借助工具来预测fragment length, 这里就不展开了。对于双端测序而言,事情...
library(tidyverse) dat<-read_delim("D:/R_4_1_0_working_directory/env001/data/20230318/Source_Data.Figure2/Fig2b.txt", delim = "\t") dat 最基本的箱线图和小提琴图 library(ggplot2) ggplot(data = dat,aes(x=`SV-type`,y=length))+ geom_violin()+ geom_boxplot() image.png 这里因为...
bam文件中每一行以reads为单位,这里去重是为了避免来自同一个fragemnts的reads重复统计。提取好之后,用R画图就可以了,R代码如下 data<-read.table("fragment.length.txt",header=F) #设置插入片段长度的阈值,过滤掉太长的片段 length_cutoff<- 1200 fragment<-data$V1[data$V1<= length_cutoff] # 利用直方图...
运行脚本前需要安装R包ggplot2。打开Rstudio,点击Tools->Install Packages。 在Install Packages里输入ggplot2,点击Install。 3 运行脚本 首先设置工作路径,点击Session->Set Working Directory->Choose Directory设置工作目录到length.txt文件所在的文件夹。 然后将barplot.R复制到Rstudio中运行。
如图示是一对等量异种点电荷的电场线分布图,图中两点电荷P、Q连线长度为r,M点、N点到两点电荷P、Q的距离都为r,S点到点电荷Q的距离也为r,由此可知( )A. M点的
D、依据点电荷的电场强度公式E=k ,及叠加原则, 则两点电荷连线的中点处的电场强度为E合=2k +k =3k ,故D正确。 故选:D。 [解析]:电场线的疏密表示电场强度的相对大小,并依据点电荷电场强度公式,及叠加原则,据此分析即可.反馈 收藏
如图所示是一对不等量异种点电荷的电场线分布图,图中两点电荷连线长度为2r,左侧点电荷带电荷量为+2q,右侧点电荷带电荷量为-q,P、Q两点关于两电荷连线对称.由图可知( )A. P、
如图所示,是一对不等量异种点电荷的电场线分布图,图中两点电荷连线长度为2r,左侧点电荷电荷量为+2q,右侧点电荷电荷量为-q,P、Q两点关于两电荷连线对称。下列说法中正确的是( -e卷通组卷网
如图为两个不等量异种点电荷+2q和-q形成电场的电场线分布图,图中两点电荷连线长度为2r,O点为两点电荷连线的中点,P、Q两点关于两电荷连线对称,已知静电力常量为k。下列判断正确的是( ) A.M点的电势高于N点电势 B.P、Q两点的电场强度相同 C.O点处的电场强度为 ...