1. Hitpredict网站收集了IntAct, BIOGRID 和 HPRD数据库中的由高通量实验或者是小规模实验得到的蛋白质互作关系,综合了三大数据库的内容,数据准确全面。此外,还有根据互作得分估计的蛋白质相互作用。 2. 目前为止,网站已经收集了人类,小鼠等9个物种的蛋白质...
理相互作⽤，也包括蛋⽩质之间的间接功能相关性。它除了包含有实验数据、从PubMed摘要中 挖掘的结果和综合其他数据库数据外，还有利⽤⽣物信息学的⽅法预测的结果。⼆：Genemania⽹站。1. Genemania也是⽐较常⽤的蛋⽩互作⽹站，⽹站结果类似cytoscape app，但是⽆需下载安装软件，直接在线使...
http://www.cuilab.cn/lnctar预测和RNA的相互作用。http://pridb.gdcb.iastate.edu/RPISeq/ http:/...
我的博士论文是蛋白质相互作用的数据挖掘方法预测,现在刚刚做出了一点东西,还没有投稿,欢迎大家试用,有意见和建议请反馈给我,谢谢!liuliang@shu.edu.cn 输入格式是FASTA格式,具体请参考在线预测的界面。 网址是 http://chemdata.shu.edu.cn/ppi 鉴于我的计算服务器不是很好,请大家提交蛋白质的序列后,耐心等待。
本文讨论了预测lncRNA与蛋白质或mRNA相互作用的网站，其中重点介绍了一个名为LncPheDB的数据库。LncPheDB不仅包含了lncRNA的信息，还对其序列、结构和功能进行了注释，方便研究者深入探索lncRNA的作用机制。在引言部分，提到在水稻研究中发现了一些错误，例如标注了籼稻而非粳稻，这突显了数据库在数据准确性...
表5蛋白质蛋白质相互作用数据库和数据库工具工具类型所在地网址bind蛋白质蛋白质相互作用途径加拿大多伦多西乃山医院dip蛋白质蛋白质相互作用加州大学洛杉矶分校mips哺乳动物的蛋白质蛋白质相互作用慕尼黑蛋白质序列信息中心hprd人类蛋白质参考资源美国约翰霍普金斯大学grid酵母果蝇和线虫的遗传和生理作用加拿大多伦多西乃山医院...
gdcb.iastate.edu/RPISeq/ http://bioinfo.bjmu.edu.cn/lncpro/ 预测和特定蛋白质的相互作用。
1、首先在http://www.targetscan.org/中输入你想了解的mRNA的基因symbol，然后会罗列出可能mRNA 3'UTR...
3.1蛋白质功能预测工具 也许生物信息学方法在癌症研究中最常用的就是基因功能预测方法,但是这些数据库只存储了基因组的大约一半基因的功能。为了在微阵列资料基础上完成功能性的富集分析,基因簇的功能注解是非常重要的。近几年生物学家研发了一些基因功能预测的方法,这些方法旨在超越传统的BLAST搜索来预测基因的功能。基因...
蛋白质功能结构相互作用预测网站工具合集蛋白质组学蛋白质是生物体的重要组成局部,参与几乎所有生理和细胞代谢过程.此外,与基因组学和转录组学比拟,对一个 细胞或组织中表达的所有蛋白质,及其修饰和相互作用的大规模研究称为蛋白质组学.蛋白质组学通常