通过对报道基因表达产物的检测,反过来可判别作为“诱饵”和“猎物”的两个蛋白质之间是否存在相互作用。 2、免疫共沉淀法:免疫共沉淀是一种比较经典的蛋白质相互作用方法,其实验比较简单。裂解细胞后,加入抗体,抗原被沉淀下来后洗涤,去除非特异性亲和再分析结合复合体。目前常使用Pull-down实验结合免疫共沉淀可以对可能...
蛋白质与蛋白质相互作用是生命科学研究的前沿和热点。许多重要的细胞生理过程,如基因复制与转录、蛋白质翻译与加工、免疫识别和信号传导,都是通过蛋白质相互作用实现的。 实验技术:鉴定特定蛋白质是否相互作用的生物学实验技术有很多种,如免疫共沉淀、酵母双杂交系统和双分子荧光互补等。但这些方法无法反映出蛋白质从空间...
AlphaFold3能够通过对药物分子(例如与蛋白质结合的配体和抗体)的预测,为药物设计赋能,从而改变人类健康和疾病过程中蛋白质的相互作用方式。 AlphaFold3在预测药物相互作用方面达到了前所未有的准确度,包括蛋白质与配体的结合以及抗体与靶蛋白的结合...
预测蛋白质相互作用有助于揭示生命现象的本质,为疾病诊断和治疗提供理论依据。本文将详细介绍几种蛋白质相互作用的预测方法。 一、基于生物信息学的方法 1.同源比对法:该方法通过比较不同物种中同源蛋白质的相互作用信息,预测目标物种中蛋白质的相互作用。同源比对法具有较高的准确性,但受限于已知相互作用数据的多少。
该工作介绍了一个基于人工智能框架UniBind,该框架利用深度学习和蛋白质结构分析来预测SARS-CoV-2的刺突蛋白突变的影响。该工作强调了在病毒宿主相互作用和新的SARS-CoV-2变体出现中理解蛋白质相互作用的重要性。UniBind整合了蛋白质三维结构和结合亲和力数据,预测了刺突蛋白突变如何影响其与人类ACE2受体和中和抗体的结合...
蛋白质通常通过与其他蛋白质相互作用来执行特定的生物功能,这对于所有生物体都是必不可少的。一个主要的例子是抗体,这是一类由免疫系统产生的Y形蛋白,用于识别、结合和与病原体表面的蛋白质相互作用。因此,如何开发方法来调节蛋白质-蛋白质相互作用已成为一个关键问题,而最普遍的策略之一是突变相互作用界面的氨基酸。
开发用于在分子和纳米尺度上分析蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)的新方法可以深入了解细胞内信号通路,并将提高对蛋白质功能以及其他生物和非生物来源的纳米级结构的理解。计算工具的最新进展,特别是涉及现代深度学习算法的工具,已被证明可以补充描述和合理化 PPI 的实验方法。 然而,现有的大多数 PPI 预测工作都使用蛋白质...
开发用于在分子和纳米尺度上分析蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)的新方法可以深入了解细胞内信号通路,并将提高对蛋白质功能以及其他生物和非生物来源的纳米级结构的理解。计算工具的最新进展,特别是涉及现代深度学习算法的工具,已被证明可以补充描述和合理化 PPI 的实验方法。
美国科学家主导的国际科研团队在最新一期《科学》杂志撰文指出，他们利用人工智能和进化分析，绘制出了真核生物的蛋白质之间相互作用的3D模型，首次确定了100多个可能的蛋白质复合物，并为700多个蛋白质复合物提供了结构模型，深入研究蛋白质相互作用有望催生新的药物。研究负责人之一、美国西南大学人类发育与发展中心助理...