生物大分子三维空间结构数据库是一类重要的生物信息学数据库。蛋白质结构数据库(ProteinData Bank,PDB)是1971年创建的国际上最著名、最完整的蛋白质三维结构数据库。另外还有蛋白质分类数据库SCOP和CATH。简介 生物大分子三维空间结构数据库是一类重要的生物信息学数据库。蛋白质结构数据库(ProreinData Bank,PDB)是...
Protein Structure Databases: Cath: Protein structure classification HIV Protease: HIV protease database 3D structure PDB: 3-D macromolecular structure data PSI: Protein structure initiative S2F: Structure to function project Scop: Structural Classification of Proteins Protein Domains, Motifs & Signatures: ...
布鲁克海文蛋白质数据库(The BrookHaven Protein Data Bank,PDB)是经实验测定的生物大分子三维结构数据档案,服务于全球科研、教育工作者和学生。其内容包括原子坐标、参考文献、一级和二级结构信息,也包括了晶体结构因数以及NMR实验数据。PDB时事通讯和CDROM每三个月发布一次。PDB概述 ---PDB由美联邦政府代理基金会与...
PDB(Protein Data Bank,http://www.rcsb.org/),是美国Brookhaven国家实验室于1971年创建的,通过X射线单晶衍射、核磁共振、电子衍射等实验手段确定的蛋白质、多糖、核酸、病毒等生物大分子的三维结构数据库,通过搜索蛋白质可以获得蛋白质结构的三维可视化(如果有配体相互作用)和结构质量指标。
PDB蛋白质结构数据库(全称Protein Data Bank,简称PDB数据库)是美国Brookhaven国家实验室于1971年创建的,由结构生物信息学研究合作组织(Research Collaboratory for Structural Bioinformatics,简称RCSB)维护。PDB数据库以文本文件形式存储分子数据,每个分子形用一个独立的文件。早期的分子文件的文件名后缀为“.pdb”,1997年以...
国际蛋白质结构数据库(PDB)全称为Protein Data Bank,是全球最主要的收集生物大分子(蛋白质、核酸和糖)2.5维(以二维的形式表示三维的数据)结构的数据库。 1、PDB发展史 PDB是美国纽约Brookhaven国家实验室于1971年创建的。布鲁克黑文国家实验室成立于1947年,历史上该实验室曾经有7个项目12人次获得过诺贝尔奖。为适应...
Protein Data Bank (PDB):https://www.rcsb.org/ ③NCBI Protein:NCBI Protein是美国国家生物技术信息中心(NCBI)提供的蛋白质数据库,包含了大量的蛋白质序列数据,可以进行蛋白质的基本信息查询和比对分析。 NCBI Protein:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/ ...
蛋白质数据库Protein Data Bank(PDB)是一个包含蛋白质、核酸等生物大分子的结构数据的数据库,网址是http://www.rcsb.org。PDB可以经由网络免费访问,是结构生物学研究中的重要资源。为了确保PDB资料的完备与权威,各个主要的科学杂志、基金组织会要...
蛋白质数据库(Protein Data Bank, PDB)是一个包含由全球生物学家和生物化学家上传的蛋白质或核酸的X光晶体衍射或NMR核磁共振结构数据的生物大分子数据库。内容主要由世界蛋白质数据库(Worldwide Protein Data Bank, wwpdb)管理,可通过PDB的会员组织如PDBe、PDBj、RCSB免费获取。PDB作为结构生物学的...