1. Hitpredict网站收集了IntAct, BIOGRID 和 HPRD数据库中的由高通量实验或者是小规模实验得到的蛋白质互作关系,综合了三大数据库的内容,数据准确全面。此外,还有根据互作得分估计的蛋白质相互作用。 2. 目前为止,网站已经收集了人类,小鼠等9个物种的蛋白...
1.CASTp 网址:http://sts.bioe.uic.edu/castp/ 网站打开缓慢,可预测蛋白活性位点。2.ConSurf 网...
下面就为大家推荐四个可以用来预测相互作用蛋白的网站! 一:STRING网站 1.STRING数据库是比较经典的蛋白互作数据库。数据库使用简单。 2. 输入基因名称后,可以获得蛋白互作网络图,其中圆圈节点之间的直线代表该直线连接的两个蛋白之间的相互作用关系,点击直线可查看蛋白的详细信息。 3.网站下方提示 不同颜色的直线代表...
1.STRING数据库是比较经典的蛋白互作数据库。数据库使用简单。 2. 输入基因名称后,可以获得蛋白互作网络图,其中圆圈节点之间的直线代表该直线连接的两个蛋白之间的相互作用关系,点击直线可查看蛋白的详细信息。 3.网站下方提示 不同颜色的直线代表不同的相互作用关系证据来源。包括蛋白质之间的直接物理相互作用,也包括...
蛋白质相互作用预测网站服务检测周期多久呀?对样品有什么要求? 产品介绍 百泰派克生物科技 - 您身边的生物质谱专家! 北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Biotech Pack Scientific Co., Ltd.简称BTP)从事以生物质谱为依托的生物药物表征,大分子物质(包括蛋白质、多肽、代谢物)质谱分析以及小分子物质检测服务。公司采用...
蛋白互作(Protein-protein interaction)在生物研究中至关重要,尤其是对于下游机制的探讨和验证。为预测蛋白互作,存在许多网站和软件工具,其中String是较为广泛使用的预测平台。然而,这些工具通常专注于预测正常蛋白之间的互作,对于融合蛋白(fusion proteins)的互作预测却相对较少。融合蛋白是由两个亲本...
此外,LncPheDB还提供了与lncRNAs相关基因的功能信息和不同物种基因的蛋白序列信息(通过搜索SWISS-PROT数据...
我的博士论文是蛋白质相互作用的数据挖掘方法预测,现在刚刚做出了一点东西,还没有投稿,欢迎大家试用,有意见和建议请反馈给我,谢谢!liuliang@shu.edu.cn输入格式是FASTA格式,具体请参考在线预测的界面。网址是http://chemdata.shu.edu.cn/ppi鉴于我的计算服务器不是很
本文讨论了预测lncRNA与蛋白质或mRNA相互作用的网站,其中重点介绍了一个名为LncPheDB的数据库。LncPheDB不仅包含了lncRNA的信息,还对其序列、结构和功能进行了注释,方便研究者深入探索lncRNA的作用机制。在引言部分,提到在水稻研究中发现了一些错误,例如标注了籼稻而非粳稻,这突显了数据库在数据准确性...
1、蛋白质组学蛋白质是生物体的重要组成局部,参与几乎所有生理和细胞代谢过程。此外,与基因组学和转录组学比拟,对一个 细胞或组织中表达的所有蛋白质,及其修饰和相互作用的大规模研究称为蛋白质组学。蛋白质组学通常被认为是在基因组学和转录组学之后,生物系统研究的下一步。然而,蛋白质组的研究远比基因组 学...