CPTAC数据库包含丰富多样的数据，涵盖了基因组测序数据和蛋白组学数据。其中，基因组数据包含了1300+不同类型的肿瘤病人，涉及全基因组测序（WGS）、全外显子测序（WES）和RNA测序（RNA-seq）的数据，可通过GDC Data Portal进行访问。蛋白组数据则通过PDC访问，主要采用质谱检测技术，包括ITRAQ和TMT等定量技...
原名:Integrated RNA-seq and Proteomic Studies Reveal Resource Reallocation towards Energy Metabolism and Defense inSkeletonema marinoiin Response to CO2Increase 译名:综合RNA-seq和蛋白质组学研究揭示了玛氏骨条藻对CO2增加的能量代谢和防御的资源再分配 期刊:Applied and Environmental Microbiology IF:4.016 发表时间...
单细胞RNA测序:10× genomics 3’ Chromium v2.0平台,Illumina HiSeq 2500测序平台;蛋白质组学分析:总蛋白提取,TMT标记和LC-MS / MS分析;flow cytometry 检测细胞离子浓度 【研究结果】 1、肌肉衍生细胞的分化潜能 (图1) 将消化得到的肌肉单细胞进行原代细胞培养并分离,培养2h以内的为Adi细胞系,培养2-72h的分离...
基于胶质母细胞瘤的单细胞 RNA-seq 确定了五组具有不同免疫和基质特征的肿瘤类型:Cold-medullo、Cold-mixed、Neuronal、Epithelial 和 Hot。对照蛋白质组分型,研究发现更具侵袭性的 aggressive、Medullo 和 Ependy 型免疫浸润较低,而 Cranio/LGG-BRAFV600E、LGG BRAFWT-rich 和 LGG BRAFFusion-rich 型,免疫浸润...
其中基因组数据包含总计1300+不同类型肿瘤病人的WGS、WES和RNA-seq数据,可通过GDC Data Portal访问。 蛋白组数据可通过PDC 访问,CPTAC数据库用到的蛋白质定量技术主要是基于质谱的检测技术,包括ITRAQ和TMT。 收集的信息如下: 此外,CPTAC数据库还提供了生物样品的元数据和临床数据,例如病人的性别、年龄、癌症类型和...
我们分别从宫颈癌I期(n = 4)和II期(n = 3)肿瘤组织中分离的所有细胞核进行了snRNA-seq实验(图1A),质量控制后共有72128个(42928个I期和29200个II期)细胞核用于下游分析(图1B和补充图1)。无监督聚类分析揭示了22种细胞...
一：已知动植物细胞内主要RNA的结构与功能(rRNA,mRNA,tRNA,miRNAetal)二：RNA在生物进化分子中的地位（RNAworldhypothesis，ribozymeetal)三：测序技术在RNA研究中的应用(一代，二代，三代测序技术)四：RNA组学常见的课题设计与数据分析（RNA-seq,RIP-seq,PAS-seqetal)RNA世界假说 1981年度诺贝尔化学奖获得者吉尔伯特...
而BD AbSeq assay 是BD单细胞多组学产品系列最新推出的创新产品,研究者可在同一次实验中同时获得单细胞RNA-Seq数据以及多重蛋白表达数据,显著增进对个体细胞和细胞群的理解。 2. 清晰可靠 BD方面表示,使用BD Pharmigen™抗体获得的蛋白质表达数据能更好地表征样本特征(例如更清楚的细胞簇识别),结合mRNA表达数据,就...
为了证实和扩展TRAP细胞类型特异性研究结果,研究人员在R6/2和zQ175DN HD模型小鼠中进行了与TRAP研究相同年龄的纹状体细胞的snRNA-seq 。研究人员利用ACTIOnet进行聚类分析,发现了一类表达Foxp2/Olfm3的神经元亚群(图 4A、4B)。由于Foxp2能双向调节HD鼠的HD样表型,因此研究人员猜测这一新定义的亚群可能构成了这一调...
在香港会场,华大智造面向全球推出一款由αLab孕育孵化的AI大模型产品αLabStudio智能实验室管理平台。在深圳会场,华大智造重磅推出升级版时空转录组FF产品方案(freshfrozen冷冻样本)Stereo-seqv1.3和DNBelabC系列高通量单细胞5'RNA&V(D)J建库试剂盒,以及SEQALL全领域应用组合产品,包括即将上市PopOmics大人群多组学组合...