预测结果如图所示，该蛋白预测结果，含有1个跨膜域（197-216 aa），N端位于胞内（1-196 aa），C端位于胞外。感觉是不是so easy，下面再介绍第二个在线蛋白预测软件Phobius。同样的，分两步走，首先找到目的蛋白的氨基酸序列，然后输入、提交、分析预测结果即可。下面是 Os08g0440000在Phobius中的预测结果，该网...
从图中可以清楚看出该蛋白的信号肽、跨膜区、胞内区和胞外区。真核蛋白信号肽在原核中不能加工造成蛋白不表达,所以进行原核表达时要去掉;对于制备抗体一般优先选择胞外区段;跨膜区不但对抗体制备没有贡献,而且还难以在原核表达,因此原核表达制备抗原一定要去除信号肽和跨膜区。 1)基本性质分析(以下截图取自文件 ...
网站地址:https://wolfpsort.hgc.jp 基因:AQP5(Aquaporin-5) 复制蛋白质FASTA序列。 选择要预测的蛋白质来自哪个物种,黏贴蛋白质FASTA序列,最后点击提交。 可以看到这个蛋白质最有可能定位在细胞壁上或细胞外,可以点击details查看具体的内容。 二、TMHMM分析蛋白跨膜区 蛋白质含有跨膜区,说明它可能是膜受体,也可能...
研究者重点分析了S2472E-Intermediate构象，其桨叶区部分展平，桨叶高度介于关闭态和失活态之间，胞外帽子发生旋转且向下移动，进而压缩了下方相连的弹簧连接器，帽子门和疏水跨膜门被打开，胞内侧的杠杆结构发生一定程度的弯折，然而此时侧向门塞仍然保持堵塞。结合分子动力学模拟，研究者认为此构象处于中间开放状态（图...
甲型流感病毒基质蛋白2胞外功能区(matrix protein 2 ectodomam,M2e)通用疫苗的确切保护机制尚未明确,但其能减轻流感症状,抑制病毒的复制、存活和传播。通过使用M2e四聚体通用疫苗、M2e病毒样颗粒疫苗以及M2e多表位通用疫苗联合佐剂等,可提高保护效果,未来...
使用TMHMM-2.0预测膜整合蛋白的跨膜区。 网站在这:TMHMM - 2.0 - Services - DTU Health Tech image-20221230221910879 图28 TMHMM主界面 从下面的结果可以看到,是膜蛋白质,下图的绿色框是跨膜结构位点。紫色的也是跨膜位点。 image-20221230221856094 图29 TMHMM结果 具有GPI固定(anchor)的蛋白质? 使用big-PI进行...
然而,跨膜区的特性、个数以及方向还取决于自己对自己研究对象的判定标准。真实情况,还需要自己用实验来验证,例如可以根据预测结果制备针对不同胞外或者胞内区多肽序列的抗体透化或者不透化进行IFA实验; 如果胞外区不透化即可用抗体染色, 说明是胞外区; 如果胞内区不...
PLV平台利用来自非包膜融合型正呼肠病毒(Orthoreovirus)的融合相关小跨膜蛋白(FAST)。FAST蛋白的长度为100-200个氨基酸残基,是已知最小的病毒融合蛋白。这些融合蛋白在病毒感染的细胞内表达,并被转运到细胞膜上,在那里它们促进细胞膜融合,产生多细胞核的合胞体,以促进病毒传播。
在细胞间期,染色质丝在细胞核内的组织结构遵循一个基本原则——区室化。在此基础上,condensin II帮助各条染色体盘踞形成染色体疆域(chromosome territory);而cohesin则在DNA上滑动,挤出染色质环,并与CTCF蛋白共同介导形成染色质拓扑结构域(TADs)。目前,植物领域对染色质高级结构的研究存在着两个主要问题:1.不同植物...
甲型流感病毒M2的胞外功能区(M2 ectodomain,M2e)包括24个氨基酸[8],研究表明,M2e在所有甲型流感病毒亚型中几乎完全保守[9],可作为广谱甲型流感疫苗的抗原,即利用M2e研发通用疫苗能够…