龙眼、荔枝煤烟病病原真菌种类多达10余种,形态各异。菌丝体均为暗褐色。着生于寄主植物的表面,形成子囊孢子和分生孢子。子囊孢子形状随种类而异,无色或暗褐色。有1至数分隔,具横隔或纵横隔膜。闭囊壳有柄或无柄,闭囊壳壁外有附属丝或无,具刚毛。