人类肿瘤具有不同数量的体细胞突变,统称为肿瘤突变负荷(Tumor mutational burden, TMB),其定义为每百万碱基中体细胞编码突变、碱基替换和插入-删除错误的总数。 2. TMB在免疫治疗中的作用? TMB可以预测患者对免疫治疗的反应,从而影响患者的预后。TMB高的肿瘤类型肿瘤特异性新抗原生成和呈递程度的增加,影响免疫应答的强...
利用TIMER数据库评估免疫基因CNVs与肿瘤免疫细胞浸润的关系以及免疫细胞在乳腺癌中的预后价值。 主要研究结果 1.分析乳腺癌样本中的突变情况 分析TCGA数据库中乳腺癌样本的突变数据,88.74%的患者存在体细胞突变。展示乳腺癌样本中突变前10位的基因。错义突变在变异分类中排名第一。单核苷酸多态性(SNPs)为主要变异类型。
一、TMB：肿瘤突变负荷 TMB 是衡量肿瘤中体细胞突变数量的指标，反映了肿瘤的遗传异质性和免疫反应性。高 TMB 肿瘤可能产生更多免疫原性新抗原，从而对免疫治疗有更好响应。二、创新分析路径 以往的生信研究中，TMB 主要用于预测免疫治疗的效果。但通过结合 TMB 评分、WGCNA 和构建风险模型的三步策略，我...
最近研究发现较高的肿瘤突变负荷(tumor mutational burden, TMB)与多种癌症类型免疫治疗后的较长的总体生存期有关,提示TMB可以作为一种免疫检查点抑制剂治疗疗效的预测生物标记物。TMB 是指特定基因组区域内体细胞非同义突变的个数,通常用每兆碱基多少个突变表示(mut/Mb),在早期研究中也直接以突变数量表示。TMB 可...
人类肿瘤具有不同数量的体细胞突变,统称为肿瘤突变负荷 (Tumor mutational burden, TMB)。评估TMB状态是预测患者预后和治疗获益的方法之一。 目前,生信文章中TMB最常见的分析,就是用于预测免疫治疗效果。 那如何针对TMB做点不一样的分析思路呢? (没有思路、不知道怎么创新的找小云,超多个性化的分析思路供你选择哦!