蛋白质生物合成亦称为翻译(Translation),指的是将生物体脱氧核糖核酸(DNA)转录得到的信使核糖核酸(mRNA)上的遗传信息(碱基排列顺序),转变为蛋白质或多肽链中的氨基酸排列顺序过程(图1)。此时的多肽链不具有生物学活性,需要经过一系列的加工和修饰才...
通过CDS翻译功能【Translated Feature 】打开一个DNA文件。在地图【Map】视图中,单击Feature选择Feature定义的开放阅读框【ORF】。 翻译这个Feature 单击菜单里的:Actions → Make Protein... 给这个蛋白质文件命名。 可选:勾选合并片段【Merge segments】以创建带有单个片段CDS注释的蛋白质。 单击【OK】即可创建新的蛋...
blastx:先将待查询的核酸序列按六种可读框架(逐个向前三个碱基和逐个向后三个碱基读码)翻译成蛋白质序列,然后将翻译结果对蛋白质序列数据库进行查询; tblastn:先将核酸序列数据库中的核酸序列按六种可读框架翻译成蛋白质序列,然后将待查询的蛋白质序列及其互补序列对其翻译结果进行查询; tblastx: 先将待查询的核酸序...
/usr/bin/perl -wmy(%code)=('GCC'=>'A','GCA'=>'A','GCT'=>'A','GCG'=>'A','CGT'=>'R','CGC'=>'R','CGA'=>'R','CGG'=>'R','AGA'=>'R','AGG'=>'R','AAT'=>'N','AAC'=>'N','GAT'=>'D','GAC'=>'D','TGT'=>'C','TGC'=>'C','GAA'=>'E','GAG'=>...
蛋白质是多肽链组成的三位结构,多肽链的氨基酸序列由DNA密码书写,编写多肽链的过程发生在核糖体,它们被称为蛋白质合成机器。根据遗传密码,来自DNA拷贝序列的信使RNA逐个聚合氨基酸分子,直到整条链的终点才从核糖体上脱离。 核糖体合成蛋白质的过程被称为“翻译”,所以生物体的所有蛋白质都是通过翻译产生的。过去人们...
将RNA 序列翻译为相应的蛋白质序列 写在前面的话: 本人是一枚生物学的学生,由于对生物信息学特别感兴趣,于是想自学生物信息学(新手莫怪)。了解到生物信息学要有编程基础,尤其是要会一门编程语言,例如:R语言、Python、Perl等,还要熟悉Linux系统,作为生信小白,听说Python挺简单的,于是就自学了Python,花了两天时间了解...
利用dictionary 可以将给定的cDNA序列翻译成蛋白序列 1#!/bin/python2#Dictionary protein translation34my_dna = open("/home/maque/my_dna.txt").read().replace('\n','')#利用 str.replace() method 将 '\n' 去掉,这样 my_dna 就是一条单一的字符串56condon_table = {"TTT":"F","TTC":"F",...
由此可见在等量mRNA丰度的情况下,添加Kozak序列能够显著提高蛋白质的翻译。 Kozak序列促进了2A肽下游基因的翻译效率(Yuancheng Wang et al. 2019. Mol Genet Genomics) 大家如果想提高蛋白质表达的,可以在序列前添加Kozak序列。
mRNA为GCA的话, 查密码子表可知密码子GCA编码丙氨酸,因此翻译后对应的蛋白质序列上是丙氨酸残基(Ala). APP内打开 结果2 举报 是cgu,因为mrna是单链,所以直接用互补配对原则就行了 结果3 举报 你先看一下密码子的含义:信使RNA上三个相邻碱基,所以信使RNA是GCA,即密码子为GCA,,翻译出来的蛋白质上没有碱基,...