线粒体全基因组测序是通过测定人体线粒体DNA中的所有碱基对,来获得完整的线粒体基因组序列的方法。这种方法因为线粒体DNA独特的母系遗传模式和较高的突变频率,被广泛应用于生物进化、群体结构、疾病诊断、法医鉴定等方面的研究。它可以帮助科研人员更深入地了解线粒体的结构和功能,以及在一些遗传性疾病中的突变情况。
3.引物设计 参照KK小鼠(登录号为EF108339)、Wistar+大鼠(登录号为AC000022)、豚鼠cavia porcellus(登录号为AJ222767)、台湾田鼠(登录号为NC003041)、南方田鼠(登录号为NC008064)等动物的线粒体基因组全序列,采用CLUSTAL×1.8软件进行序列比对排列后,用Oligo6.0软件设计可覆盖中国地鼠线粒体全基因组的引物27对(表8...
但是到目前为止,还没有研究发现某个特定的mtDNA突变与PTB之间有决定性的联系,这可能部分归因于线粒体基因组的不寻常的遗传特性。 虽然低覆盖度全基因组测序 (lcWGS) 的数据在核DNA上的覆盖度非常低 (通常约为1X-2X),但由于mtDNA...
对于线粒体全基因组测序数据,通常可以通过比对到参考基因组(如人类线粒体基因组)来评估数据质量。 接下来,进行线粒体全基因组的变异分析。首先,将测序数据与参考线粒体基因组进行比对,生成比对结果。然后,利用比对结果,进行变异位点的检测和分析。常用的变异类型包括单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms, ...
全基因组测序可发现约一半疑似线粒体疾病患者的突变。 线粒体疾病是遗传性代谢疾病的常见原因,但其诊断仍有难度,部分原因是临床表现和发病年龄有差异、受累组织有差异、异质性以及细胞核和线粒体基因组双重表达。为了确定全基因组测序方法对线粒体变异的检出率,研究...
一、线粒体基因测序 线粒体DNA(mtDNA),也叫线粒体基因组,多数是环状结构,少数是线型结构。因物种的不同,线粒体基因组的大小也不相同,一般植物细胞中最大,也更复杂,100~2500碱基对(kb),动物细胞中比较小,约为10～39千个kb;哺乳动物的最小,约为16.5kb。线粒体基因组携带的基因数量并不多,迄今已知,它编码...
摘要: 通过二代测序、软件拼接获得中国黄海海域黄条鰤(Seriola aureovittata )线粒体基因组全序列。其序列全长为16609 bp, 碱基组成分别为A(26.68%)、G(17.84%)、C(30.12%)和T(25.36%); 共有13条蛋白编码基因, 22个tRNA 基因, 2个rRNA 基因, 除NAD6、trnQ 、trnA 、trnN 、trnC 、trnY 、trnS...
摘要:在基因组水平上,比较分析了已登录GcnBank的19种龟鳖类线粒体全基因组的结构特征,结果表明:1)除平胸龟、扁陆龟外,其余17种龟鳖类线粒体基因组结构、基因排列顺序均与典型的脊椎动物相似,显示龟鳖类线粒体基因组在进化上十分保守:2)19种龟鳖类线粒体全基因组和各部分的碱基组成均表现出高AT、低G含量的偏向...
1.一种用于线粒体全基因组测序的引物集,其特征在于,所述引物集包括引物子集p1,引物子集p2,引物子集p3和引物子集p4,其中所述各引物子集中含有的引物是不同的,并且所述4个引物子集的全部扩增产物完全覆盖线粒体DNA;并且,所述的引物子集p4包括序列如SEQ ID NO.:1-8所示的引物;并且,所述引物集中包含的引物所对应...
2.一种线粒体全基因组DNA扩增方法,所述方法包括,采用权利要求1所述的引物对组,以线粒体DNA为模板,进行PCR扩增。 3.根据权利要求2所述的线粒体全基因组DNA扩增方法,其特征在于:所述PCR扩增时,各引物对的退火温度为52-56°C,优选为56°C。 4.一种线粒体全基因组测序方法,所述方法包括,采用权利要求2或3...