在Slide-seq方法发表后不久,另一种使用更小的条形码珠子的技术发布,命名为高分辨率空间转录组技术(HDST)。 Nanostring GeoMx Digital Spatial Profifiler Nanostring GeoMx Digital Spatial Profifiler的差异化在于它能够应用于FFPE样品。该仪器还具有空间剖析蛋白质的能力,尽管不是在同一组织切片上。它以迭代的方式工作,...
这时候可以使用空间转录组来帮助理解多细胞生物的细胞和组织功能,从生理、形态、解剖背景以及空间结构中绘制细胞图谱。 空间转录组技术分类 依据通量可以将空间组学分为两类: 低通量:微解剖基因表达技术、原位杂交技术和原位测序技术 高通量:基于空间条形码的技术——Nanostring、10X Visium、Slide-seq、STOmics、Seq-sco...
空间转录组技术用于在空间水平上解析基因表达数据,可以同时获得细胞的空间信息和转录模式,以提高我们对组织微环境的理解。空间转录组可以结合显微成像和测序技术来获取基因表达数据,同时最大程度地保留样本的空间位置信息,使研究人员能够找到更有价值的结果。目前,基于不同的检测原理,发展出多种多样的空间转录组技术。为了...
肺纤维化研究：转化基因组研究所生物创新与基因组科学部及空间多组学中心副主任Nicholas Banovich博士将分享他的研究成果，并强调高分辨率空间转录组学在揭示肺纤维化新型疾病机制方面的强大潜力。"因美纳全新空间组学技术的规模和灵敏度使我们能够在大型组织切片中研究整个转录组。我们利用这项技术进行的早期分析已经识别并...
该癌旁样本使用了4mm x 4mm规格的M20 Spatial芯片进行检测。值得注意的是，M20 Spatial技术不仅捕获了与新鲜冻存样本空间转录组技术相当水平的UMI数和基因数，还实现了全转录组捕获，使得总基因数远超其他基于polyA捕获或mRNA靶向探针捕获的空间转录组平台。02 分辨率 当分辨率提升至15μm时，M20 Spatial在小鼠嗅球...
可以考虑基于图像的空间转录组测序技术。这类技术直接在切片表面完成RNA探针结合、扩增、信号检测等实验操作,在保证检测敏感度的同时,最大程度减少RNA扩散,从而提高数据可靠性。Xenium技术就是这个技术路线的佼佼者。Xenium平台基于10x Genomics从ReadCoor和Cartana公司获得的基础技术(这两项技术分别由George Church和Mats ...
Visium HD空间转录组是10x Genomics公司于2024年1月重磅推出的高分辨率空间转录组高通量测序技术。该技术一经推出，立即受到广泛关注。欧易生物作为提供10x Genomics产品科研技术服务的国内头部企业，来咨询Visium HD样本准备和各种技术细节问题的老师更是络绎不绝。为此，我们精心挑选和整理了与实验技术原理相关的九个经常...
空间转录组技术是一种高通量的基因表达分析技术,它可以同时测定多个基因在不同细胞类型、不同组织类型和不同发育阶段中的表达水平。它可以提供更加精确的基因表达信息,从而更好地理解基因的功能和调控机制。 空间转录组技术的基本原理是,通过测序技术,将基因组中的基因序列拆分成多个小片段,然后将这些小片段放入特定的...
空间转录组是指从空间层面上解析RNA-seq的技术,进而解析单个组织切片中的所有mRNA,从而能够定位和区分功能基因在特定组织区域内的活跃表达。空间转录组可以同时获得细胞的空间位置信息和基因表达数据。空间转录组描述了组织学切片特定区域内的细胞簇、细胞间的相互作用、转录信号和表型,并以此作为临床影像的参考和对应。空...
然而，常规空间转录组技术虽然能够有效地保留序列的空间信息，但是由于文库构建上的限制，VDJ 序列无法保留在测序文库中，因而很难获得克隆信息。在本次研究中，该课题组基于 Visium 空间转录组平台，开发了 Spatial VDJ 技术。他们还开发了长读长（long-read，LR）Spatial VDJ 以及短读长（short-read，SR）Spatial ...