空间转录组可以同时获得细胞的空间位置信息和基因表达数据。空间转录组描述了组织学切片特定区域内的细胞簇、细胞间的相互作用、转录信号和表型,并以此作为临床影像的参考和对应。空间转录组学被认为是将分子信息与临床图像相结合的一个重要组成部分。 空间转录组技术的核心在于如何获取组织中不同空间位置的信息。基于此,...
一、空间转录组技术概述 1.1 空间转录组技术概念 空间转录组技术旨在对细胞的基因表达进行定量测量,同时提供细胞在组织空间的具体位置信息。与传统的转录组技术相比,空间转录组技术能获得细胞在组织生理环境下真实的基因表达特征,以及与微环境的关系,进一步推进对正常和病理状态下细胞特性的理解。近年来,空间转录组技术的...
也因此,空间转录组技术在生物医药研究的多个领域展现出巨大应用潜力。 2023年10月,我们正式对外发布全球首个基于随机引物的全样本空间全转录组技术——“M20 Spatial”,引领空间转录组技术走进多物种、全样本、全转录组和全长序列的新时代(点击查看)。 图1. M20 Spatial工作流程及原理 与传统空间转录组技术相比,M20 ...
与标准的单细胞方法不同,ST保留了捕获的转录组的空间背景,从而允许直接观察细胞和它们在组织空间中的相互作用的排列。而目前市场上可用的空间转录组技术,其中商业化的空间技术主要受限于相对较高的成本、有限的分辨率以及高特异性捕获等,非商业的空间技术又受限于较低的捕获效率以及繁琐的实验操作等,且均还难以实现端...
细胞具有空间位置特性,才能行使正常的生命活动。空间转录组技术的出现,让我们能够获得组织形态学下的基因表达谱和空间位置分布信息,帮助在空间组织中进行更精细、准确的空间分布特征研究。 从冰冻、石蜡包埋样本制备到个性化分析服务,基迪奥生物拥有丰富的空间转录组项目经验,涉及的物种经验达70+种、100+种组织项目经验,产...
空间转录组技术是结合成像、生物标记、测序及生物信息学等工具对组织切片的基因表达进行空间定位的一项技术。先后在2023年,被评选了在未来最有潜力对世界产生极大影响的十大技术之一;在2022年,被Nature评为值得关注的七大技术之一;在2020年被...
空间转录组技术的比较 基于微解剖基因表达的技术 捕捉空间基因表达信息的方法只是通过从样本中分离出目标区域,然后将这些区域单独放入试管中进行RNA提取和后续的基因表达谱分析。虽然解剖单个区域进行后续的测序可以完整地提取不同形式的RNA种类,实现同工型存在等分析,但一般来说,覆盖较大的区域通常很麻烦,而且在整个组织...
根据其细胞定位方式、RNA捕获和定量方法、引物序列设计等方面,空间转录组技术包含了4种主要技术类型[7]。 (1)基于显微解剖的基因表达技术:其特点是手工操作的成本高、细胞通量低,如激光捕获显微切割技术,通过固定脑组织切片、显微镜定位、激光束切割目标区域,再提取切割的...
空间转录组技术的应用非常广泛,它可以用于研究基因的功能和调控机制,也可以用于研究疾病的发病机制,以及研究药物的作用机制。此外,空间转录组技术还可以用于研究基因组的结构和功能,以及研究基因组的进化。 总之,空间转录组技术是一种新兴的基因表达分析技术,它可以提供更加精确的基因表达信息,从而更好地理解基因的功能和...
本期就10×Genomics产品:空间转录组10x Genomics Visium所需的动植物样品的样品采集及运输细则展开说明。 1动物样品采集 1. 取新鲜组织,大小以10mm×8mm×6mm为佳;若组织块较大,请用刀片切除非必须部位,以保证组织可以放置进模具中;请务必切除结节和脂肪组织,否则会影响最终有效数据量。