近日美国斯坦福大学研究团队在 《Cancer Discovery》(IF=29.7)上发表名为“Spatially segregated macrophage populations predict distinct outcomes in colon cancer”的文章。 5+亚群空间分布动态关联临床结局…
使用seurat::AverageExpression代表 每个细胞亚群对应每个基因的表达值
表达C1qC的巨噬细胞在不同的人类肿瘤中构成了独特的巨噬细胞亚群;然而,在对几种人类癌症中巨噬细胞的泛癌分析中,C1qC表达在几种独特的巨噬细胞亚群和各种癌症中高度表达,但也并不代表独特的巨噬细胞亚群。 免疫细胞空间分布与癌症预后 TAMs六大类亚群 按照其空间分布...
沪江词库精选空间亚群英文怎么写及英语单词、英语单词怎么写、例句等信息 space groupoid 相似短语 be on space 投稿为生 in space 片刻,马上,一会儿 in the space of 在…时间内 the space of (多少年)之间 space to space n.空间对空间 space to space link 【计】 空间-空间链路 space of ...
综上所述,通过引入单细胞“伪空间”的概念,scSpace首次实现了从空间角度对scRNA-seq数据进行分析,有效地恢复了单细胞之间的空间关联,并识别存在空间特异性的细胞亚群。scSpace算法现已开源至GitHub平台(https://github.com/ZJUFanLab/scSpace)。 ★ 本文第一作者为浙江大学药学院博士生钱竞扬和刘子齐、长三角智慧绿...
图5 卵巢癌CAFs亚群空间位置分布（ST-seq）有了空间位置细胞注释信息就可以开始研究细胞间相互作用关系了...
特别的,本工作结合空间转录组数据和单细胞测序数据,鉴定出一个肝脏CAF亚群,其高表达CTGF、FSTL1、COL1A2、COL4A1、COL4A2,命名为F5-CAF。该亚群更倾向于分布在肿瘤巢内或与癌旁交界区域,并与高干性特征的肝癌细胞存在显著的共定位现象...
作为空间生物学领域一支重要的领导力量，NanoString一直致力于开发更优化的平台和工具来帮助研究者更好地开展和利用空间组学数据。单细胞测序可以鉴定组织中不同的细胞类型和亚群，但是单细胞测序无法回答的一个核心问题是：这些不同类型的细胞在组织中的空间排布是怎样的？空间组学技术可以实现测量不同组织空间区域的基因...
《Nature Communications》(IF=16.6)发表的一项题为“Single-cell and spatial multi-omics highlight effects of anti-integrin therapy across cellular compartments in ulcerative colitis”的研究,使用单细胞技术和空间多组学技术探讨了VDZ治疗过程中UC患者体内细胞亚群的变化,发现了在VDZ治疗过程中的特征细胞及其空间...