性状相关性分析与可视化（一）生活里的性状谜题 那是一个阳光正好的周末，晓峰在自家温馨的小院里摆弄着他精心栽种的花花草草。这些花草就像他的宝贝，每一盆都倾注了他的心血。他发现，有些同种的花，花期和花朵大小却不一样，有的早早绽放出硕大艳丽的花朵，有的却姗姗来迟，花朵也小巧玲珑。这一现象如同一个...
大豆结瘤性状受多基因调控,因此,挖掘大豆中调控共生结瘤的QTL或重要基因,对提高大豆共生固氮效率及分子辅助育种具有重要意义。 近期,安徽农业大学农学院王晓波课题组联合河北省农林科学院粮油作物研究所闫龙课题组完成的题为“冀北坝上大豆结...
利用液相芯片对RIL群体进行基因分型,得到的高质量单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点和表型数据进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),挖掘控制棉籽大小相关性状的数量性状遗传位点(quantitative trait
R语言中cor函数,只能计算相关系数,如果想要计算显著性,需要两两用cor.test进行,如果是多列数据,操作比较麻烦。这里介绍两个包,非常方便的进行多列数据的相关系数及其显著性的检验,并且给出可视化。 1. 模拟数据 这里模拟出10列数据,转化为数据库,是100行10列的数据,目的是为了计算这10列的相关系数及其显著性,虽然...
玉米15个DUS测试性状相关性分析.doc,玉米15个DUS测试性状相关性分析 摘要:为减少玉米DUS测试中大量数量性状调查时人力和时间的投入,对自交系和单交种各200份材料的9个群体目测性状和各40份材料的6个个体测量性状进行观测和相关性分析。结果表明,自交系和单交种的Char.16
水稻驯化相关性状解析 03月22日 一、水稻驯化的概述 水稻是人类的粮食之一,其驯化是人类农业史上的一次伟大进步。水稻原产于中国,经过长期的农业实践中过筛选和育种,逐渐形成了现代水稻的品种。 二、驯化相关性状 1. 颖果长度 在水稻的驯化过程中,颖果长度的改良是非常关键的一个方面。改良颖果长度可以让水稻...
多个优异单倍型在小麦品种中的聚合,克服了产量性状间的权衡效应,促进了株高、分蘖数、穗粒数和千粒重等多个产量性状的协同改良(图2)。即使在干旱、高温胁迫和不同种植密度下,小麦中优异单倍型的聚合仍能促进产量提高(图3)。 图2 TaCYP78A3/5/16/17-Ap优异单倍型对小麦产量相关性状改良的聚合效应...
再者，由于FLL和FLW分别与千粒重（GW）和每穗粒数（GNPS）呈显著正相关，因此在人工选择过程中常常作为一个重要的表型性状为育种家所重视。近年来，尽管围绕旗叶性状所做的研究很多，但大多数基于双亲群体，造成遗传标记的应用潜力有限。关于关联分析（GWAS）方面的研究相对较少。另一方面，前人的研究表明，传统的基于...
多个优异单倍型在小麦品种中的聚合,克服了产量性状间的权衡效应,促进了株高、分蘖数、穗粒数和千粒重等多个产量性状的协同改良(图2)。即使在干旱、高温胁迫和不同种植密度下,小麦中优异单倍型的聚合仍能促进产量提高(图3)。 图2 TaCYP78A3/5/16/17-Ap优异单倍型对小麦产量相关性状改良的聚合效应...