百创S3000捕获面积依然为6.8mm*6.8mm,相同面积内spots数目较之前提升~2倍(从200多万提升至400多万个),即相同面积内的捕获位点得到了接近翻倍的提升。实际密度效果提升动图展示: 随着捕获位点密度的提升,对于相同大小的细胞,将能被更多的...
根据读取的数据创建Seurat对象，包含细胞的基因表达信息和空间位置信息。可能需要调整创建对象的函数参数以适应百创S3000数据的高分辨率和大量spot。数据预处理：对Seurat对象进行预处理，包括过滤低表达基因、标准化表达量、识别高变基因等步骤。这些步骤有助于减少噪声并提高后续分析的准确性。空间分析：利用Seu...
本着持续创新,深耕时空领域的决心,又经过潜心研发,百创智造于2024年3月27日在山东青岛正式发布了百创S3000空间转录组芯片,让空间组学的性能再进一步。 百创S3000在6.8mm*6.8mm 的捕获区域内铺设了4,144,770个捕获位点,相邻两个捕获位点的中心距为3.5μm。 相较于现在广受市场认可与好评的百创S1000转录组芯片,...
近日,百迈客生物在青岛发布我国生命科研行业最新空间转录组芯片百创S3000。相较于现在广受市场认可与好评的百创S1000转录组芯片,百创S3000捕获位点数提升近2倍,分辨率同样提升近2倍。在相同的测序饱和度下,单细胞级别分辨率下中位UMI提升了30%~70%,中位基因数提升30%-60%。发布会现场,百迈客生物创始人兼CEO郑洪...
相比于S1000,百创S3000芯片上spot点之间的距离更近,在相同面积大小的情况下,点的密度更高,因此对于RNA的捕获也更具效率(S1000芯片上约200万个spot点,S3000约400万个spot点)。在相同组织类型、相同饱和度的情况下,单细胞级的中位基因组数和中位umi数可以得到有效的提升。
本着精益求精的技术追求,百创智造将于2024年3月27日在中国青岛,正式发布百创S3000空间转录组芯片,届时会对其性能进行详细的介绍,同时也会邀请行业专家进行交流分享。 活动信息 时间:2024年3月27日 地点:青岛市黄岛区·高科技产业中心3号楼 主办方:百迈客生物 ...
53 Published by 百创智造 at 2024年7月1日 Categories Tags 【原始数据下载】 物种信息:小鼠脑 空间芯片:BMKMANU S3000 测序策略:Illumina 测序数据量:494G 下载链接:https://ngdc.cncb.ac.cn/search/ Prject_ID:CRA015830 【BSTMATRIX 分析结果下载】 分析软件BSTMatrix下载链接:http://www.biomarker.com....
2024年3月27日,百创智造正式发布百创S3000空间转录芯片。相较于百创S1000空间转录组芯片,百创S3000会在多方面显现出更为卓越的优势。目前,已有多家企业拥有自主研发的空间转录组学芯片产品。例如,华大时空组学技术 Stereo-seq和10X Genomics空间转录组芯片。与之相比,百创S3000性能有更大的提升。
近日,百迈客生物在青岛发布我国生命科研行业最新空间转录组芯片百创S3000。相较于现在广受市场认可与好评的百创S1000转录组芯片,百创S3000捕获位点数提升近2倍,分辨率同样提升近2倍。在相同的测序饱和度下,单细胞级别分辨率下中位UMI提升了30%~70%,中位基因数提升30%-60%。
“捕获位点数提升近2倍,分辨率同样提升近2倍……”3月27日,我国生命科研行业的一颗新星——百创S3000空间转录组芯片在青岛正式发布。 据悉,目前国内已有多家企业拥有自主研发的空间转录组学芯片产品。例如,百创自主研发的S1000以及华大时空组学技术Stereo-seq和国外公司10X Genomics空间转录组芯片,相较于之前产品,此次...