高通量测序结果分析流程 2017.03.15 一、确认性别 申请单与计算性别 一致 不一致 有分析原因 临床提示是否有性别发育异常字眼 核对采血无管信息 （及家属样本）报告单提示是否存在SRY 重提DNA（多个样本性别不符？）重新采样 二、筛选基因与位点---Risk值 Risk突变类型a和HGMD/clinvar人群频率情况 判断 数据库收录...
1、火山图 RNA-seq中,火山图(Volcano Plot)显示了两个重要的指标:fold change和校正后的p value,利用T检验分析出两样本间显著差异表达的基因后,以log2(fold change)为横坐标,以T检验显著性检验p值的负对数-log10(padj)为纵坐标。 图示解释: 红色点表示TS样本相对于对照样本CK表达量上调的基因,绿色点表示下调...
高通量测序结果分析流程 2017.03.15 一、确认性别 申请单与计算性别 一致 不一致 有分析原因 临床提示是否有性别发育异常字眼 核对采血无管信息 （及家属样本）报告单提示是否存在SRY 重提DNA（多个样本性别不符？）重新采样 二、筛选基因与位点---Risk值 Risk突变类型a和HGMD/clinvar人群频率情况 判断 数据库收录...
耐药细菌基因组测序结果分析流程Illumina测序的短读序Reads1.拼接AssemblySpadesStatisticswithoutreferencescaffolds#contigs93#contigs(>=0bp)151#contigs(>=1000bp)69Largestcontig346920Totallength5297568Totallength(>=0bp)5309406Totallength(>=1000bp)5280561N50236790N75102743L509L7517GC(%)55.091.拼接Assembly组装后的...
克隆文库测序结果分析流程 下载积分: 100 内容提示: 注意事项:1、fasta文件可以用写字板打开。2、Bioedit 在edit模式下才可以进行切头去尾的操作。3、文件的排序跟DNAMAN有关,可能需要手动调整。4、记录所有去除的序列编号和原因。5、可信序列长度介于600-800bp的,需单独逐条去除尾端序列,再进行blastn验证。6、...
克隆文库测序结果分析流程 分区信息的第1 页
软件/程序步骤 合并序列文件 去除Gap 去除两端序列 去除垃圾序列 汇总种属信息 整理数据做图表 DNAMAN MEGA Classifier分析结果 Bioedit Classifier Classifier/ blastn 低质量序列 Vector 克隆文库测序结果分析流程 2011年4月25日 12:02 分区信息的第1页 1、用多重比对(MultipleSequenceAlignment)打开原始数据 2、输出...
耐药细菌基因组测序结果分析流程 lumina测序的短读序 Reads BHACXX:1:2109:12115:95954#/2 CATTGGCGCAACCGCGCAC TACGTCAATGACAATCTGGACGAAGGCCCAATCATCATGCAGGAGGTAATTCA CACACCTACACGGCA oIs hc tor o sh baRk ebdgbfeaHU UX aa b[GZb]bbbccJ1 FCC37BHACX:1:2112:5056:475 ATCCIGCGCATGGCACCATACCAGCGA...
耐药细菌基因组测序结果分析流程 46、我们若已接受最坏的，就再没有什么损失。——卡耐基47、书到用时方恨少、事非经过不知难。——陆游48、书籍把我们引入最美好的社会，使我们认识各个时代的伟大智者。——史美尔斯49、熟读唐诗三百首，不会作诗也会吟。——孙洙50、谁和我一样用功，谁就会和我一样成功。