真核基因组：由真核基因编码的以及感染真核生物的DNA和RNA病毒编码的基因组。概念 真核生物的基因组一般比较庞大，例如人的单倍体基因组由3×10⁶ bp碱基组成，按1000个碱基编码一种蛋白质计，理论上可有300万个基因。但实际上，人细胞中所含基因总数大概会超过10万个。这就说明在人细胞基因组中有许多DNA序列...
该项研究中作者采用实验室前期开发的用于系统分析基因编辑产物的高通量测序方法——PEM-seq5（Cell Discovery | 胡家志研究组开发出优化基因编辑和追踪DNA修复的新方法），发现在核基因组编辑过程中，线粒体DNA片段可能插入到靶向位点，与此同时线粒体DNA的靶向编辑也会引发线粒体DNA的不稳定，导致其插入到核基因组中...
作者进一步通过特异性扩增靶向位点的插入序列证明在基因编辑过程中线粒体DNA碎片可以插入到核基因组的靶向位点,且线粒体药物CCCP和Paraquat处理或在线粒体引入DSB都能显著增加核基因组靶向位点mtDNA的插入,说明这一事件频率受到线粒体DNA稳...
线粒体是细胞中的“动力工厂”,与核基因组不同,线粒体基因组较小且呈环状,仅包含少量基因,然而其突变却可能导致一系列遗传性疾病[1]。线粒体DNA与核基因组DNA由线粒体膜和核膜分别包裹,互相隔绝。然而在“内共生学说”中,原核生物来源的...
核体基因组是由包含32亿个核苷酸的DNA组成，分为24个线性分子，最短的50Mb，最长的260MB，每个分子包含在不同的染色体中的基因组。基因(遗传因子)是具有遗传效应的DNA片段(部分病毒如烟草花叶病毒、HIV的遗传物质是RNA)。基因支持着生命的基本构造和性能。储存着生命的种族、血型、孕育、生长、凋亡等过程的全部信息...
单一顺序(uniquesequence)约占基因组的60%-65%,这种顺序在一个基因组中一般仅有单个或几个拷贝,大多数编码蛋白质和酶基因属于此类。单一顺序还以间隔顺序和散在分布在重复顺序构成侧翼。(二)重复顺序重复顺序(repetitivesequence)是指在一个基因组中有很多拷贝,又可分为几类:1.高度重复顺序(highly repetitive ...
更别说实践起来的时候,各种坑都踩了个遍,诸如此类分析的流程和标准,以及为什么要这样做,当时也没能解决。写这篇的目的在于记录找新基因或者是个性化基因的本地自建库流程以及当时迷惑的点,也供其他小白同志们参考一下,这种方法也适用于真核生物的建库。
用户可以通过 3 种方式锁定自己的目标序列:基因组位置、序列、基因 ID,IMP 会提取对应的序列并采用Primer3根据设定的参数设计引物,输出引物表格。 多序列比对展示 多序列比对是系统进化树构建的前缀,IMP 支持用户直接输入序列或提供基因名字自动提取序列进行多序列比对。
研究团队前期研究工作发现叶绿体基因组稳态可以通过活性氧信号反馈调控细胞核基因组稳态，建立了叶绿体和细胞核基因组稳态维持之间的桥梁（Duan et al., Cell Reports 2020）。本研究通过系统鉴定模式植物拟南芥叶绿体和细胞核双定位蛋白，发现叶绿体和细胞核双定位蛋白CHLOROPLAST AND NUCLEUS DUAL-LOCALIZED PROTEIN 1(CND1...