一般来说,杂合度可以通过基因型数据来计算,其中每个基因型都是一个杂合态或纯合态。例如,在某基因位点上,存在两个等位基因A和a,如果一个个体的基因型为AA,则其为纯合态,如果为Aa,则其为杂合态。因此,如果我们现有一批样本基因型数据,我们就可以通过计算总的杂合基因型数与总的个体数的比率来得出该种群的平均杂...
群体遗传结构分析——位点杂合度 计算杂合度,通常使用plink软件 我们有两种方法: 在PLINK中 --hardy 选项是用来计算每个位点的群体杂合度的。输出的结果中,杂合度是基于期望的等位基因频率来计算的,可以用来检测偏离Hardy-Weinberg平衡的位点。 --het 选项则是用来计算每个个体的杂合度的。这个选项的输出结果可以用...
杂合度(heterogosity,He)是指在一个多态位点,一随机个体含有任意两个不相同等位基因的可能性,即为杂合子的可能性。 计算杂合度可以利用plink软件,输入文件可以是vcf格式。我们可以计算vcf文件中某个个体的整体杂合度也可以计算某个位点在该群体中的杂合度,文章中用的是后者。 (一)计算个体的杂合度 Fig 2 Fi...
A.杂合度是指杂合子所占的比例 B.杂合度计算公式1-中,是指杂合子的频率 C.杂合度计算公式1-中,是指纯合子的频率 D.1-为杂合子的频率相关知识点: 试题来源: 解析 杂合度是指杂合子所占的比例;杂合度计算公式1-中,是指纯合子的频率;1-为杂合子的频率 反馈...
het表示杂合度,为2.36%;len表示基因组大小,为67M左右。输出目录文件列表如下 代码语言:javascript 复制 ├── model.txt ├── plot.log.png ├── plot.png ├── progress.txt └── summary.txt 通常关注summary.txt,plot.png 这2个文件就可以了。
百度试题 题目[名词解释] 杂合度 相关知识点: 试题来源: 解析 是遗传变异的一个量度,是指基因座上是杂合的个体的平均频率,或称为群体的平均杂合性。反馈 收藏
以下关于杂合度描述正确的是A.杂合度是指杂合子所占的比例B.杂合度计算公式 1- 中, 是指杂合子的频率C.杂合度计算公式 1- 中, 是指纯合子的频率D.1- 为杂合子的频率搜索 题目 以下关于杂合度描述正确的是 A.杂合度是指杂合子所占的比例B.杂合度计算公式 1- 中, 是指杂合子的频率C.杂合...
为了在GWAS分析中得到可靠的结果,我们需要严格进行质量控制,其中很重要的一环就是筛掉杂合性异常的样本,因为通常情况下过高或过低的杂合度一般意味着样本存在污染,或是存在近亲相交。 plink提供了—het的选项,可以通过距估计来估计F统计量 (F-statistics or fixation indices): ...
花生杂合度指的是花生种质资源中的异质性程度,一般情况下是通过分析花生染色体的遗传特征来进行评估。花生杂合度越高,就意味着种间杂交和基因重组的机会越多,因而可能获得更好的育种效果。花生种植者通常会度量一些指标来评估花生品种的杂合度,比如可可碱酸盐含量、甜度、蛋...