关于微阵列芯片和RNA-seq的比较 转录组代表存在于细胞中RNA的全部类型,包括mRNA、rRNA、tRNA以及其它各种非编码RNA等。转录组是了解细胞过程的主要手段,微阵列(Microarray)和RNA-seq(RNA sequencing)是转录组分析中的两种主要技术。它们的主要区别在于,微阵列基于预先设计的标记探针与目标cDNA序列的杂交,而RNA-seq通过测...
转录组代表存在于细胞中RNA的全部类型,包括mRNA、rRNA、tRNA以及其它各种非编码RNA等。转录组是了解细胞过程的主要手段,微阵列(Microarray)和RNA-seq(RNA sequencing)是转录组分析中的两种主要技术。它们的主要区别在于,微阵列基于预先设计的标记探针与目标cDNA序列的杂交,而RNA-seq通过测序技术对cDNA链进行直接测序。 微...
微阵列技术不能用低丰度的转录本进行,且不能区分同工型以及鉴定遗传变异。此外,探针也常伴随交叉杂交,非特异性杂交等问题。 微阵列芯片 RNA-seq RNA-seq是一种快速且高通量的方法,不依赖于预先设计的探针或已知的序列碱基特征,因此具有较高的灵敏度和检测新基因以及遗传变异的能力。 首先提取总RNA并在纯化后片段...
需要两个准备文件,芯片或者测序表达矩阵以及参考数据集。表达矩阵格式第一列是基因名,第一行是样品名,不能有重复基因名,第一列列名不能空白。矩阵中不能存在空白或NA值,不要对表达量取Log2。 二、ImmuCellAI-mouse 链接 这是一个 国人开发的工具 ,根据RNA-Seq或微阵列数据的基 ...