微生物代谢产物分析是一个广泛的领域，包括许多不同的技术和方法。这些方法用于检测和分析微生物在生长和繁殖过程中产生的各种化合物，包括酶、抗生素、有机酸、醇、氨基酸、蛋白质等。以下是一些常用的分析方法：气相色谱-质谱联用（GC-MS）：这种技术可以用来分析挥发性和半挥发性的微生物代谢产物。样品首先通过气相...
气相色谱-质谱联用是一种强大的样品检测技术，用于分析挥发性和半挥发性化合物。在微生物代谢产物分析中，GC-MS可以精确鉴定和定量样品中的有机酸、醇和酯等成分。液相色谱-质谱联用（LC-MS）液相色谱-质谱联用则更适用于检测非挥发性的复杂有机分子，如蛋白质、肽和其他生物大分子。在第三方检测机构的标准操作...
通过计算物种多样性、组成、丰度和代谢物丰度一一对应的相关性系数大小,衡量微生物与代谢物含量变化之间的线性关系程度,相关系数越接近1,两个变量之间存在正相关;相关系数越接近-1,则存在负相关,|相关系数|>0.8认为是强相关,通过 p value<0.05辅助判断是否具有显著相关。 常见分析方法包括Pearson用于衡量两个连续变量之...
分析代谢组学数据表明,早产且剖腹产的婴儿与足月(剖腹产和顺产)婴儿的尿液代谢物在功能上有所不同。协惯量分析(CIA)显示婴儿的尿液代谢组和粪便微生物群之间存在相关性,并发现色氨酸和酪氨酸代谢途径以及脂肪酸和胆汁酸代谢受分娩方式和胎龄的影响。 图5 代谢物与肠道微生物相关性 本研究纳入223名终末期肾病(ESRD...
1.微生物的培养 微生物的培养是代谢分析的第一步。在实验之前,必须制备好含有基础培养物的培养基,并将微生物在培养基中培养。这个过程需要在一定的温度、湿度、气氛条件下进行。不同的微生物需要不同的培养条件,环境条件的变化可以影响代谢途径,从而影响微生物代谢产物的生产。 2.代谢阳极反应 代谢阳极反应是微电极...
微生物-代谢物相关关联,研究人员还将囊性纤维化病人的肺粘液上的微生物群落上的微生物-代谢物数据带入模型进行分析预测,识别出了4-羟基-2-庚基喹啉,绿脓素,申嗪霉素,2-壬基-4-羟基喹啉等代谢物分子与铜绿假单胞菌(P.aeruginosa) 共现概率很高,还识别出了鼠李糖脂可能是被铜绿假单胞菌代谢产生的代谢物分子...
分别进行微生物组和代谢组分析以后,运用多组学分析技术,将微生物组学数据和代谢组数据进行关联分析,深入探究疾病发展机理,微生物与动植物互作机制等,微生物组与代谢组联合分析的大致流程图如下所示: 结果展示: 一. 差异微生物和代谢物的 Spearman /Pearson相关性...
代谢组学分析表明,磷肥显著改变了土壤代谢物,差异代谢物显著富集到包括精氨酸和脯氨酸代谢、植物激素生物合成、氨基酸、植物次生代谢物、鸟氨酸衍生生物碱等在内的7个主要代谢途径。 此外,通过相关分析我们发现,微生物与代谢物的积累密切相关。 我们的结果表明,局部适当的磷肥在调节土壤微生物代谢中起着重要作用,它们在...
微生物代谢是指微生物分解、合成各种代谢物的一系列生化反应。在过去的一段时间,研究者们在微生物代谢分析领域做了大量的研究工作,发展了高灵敏度高特异性的光学/电学分析方法,微生物代谢分析这一领域也引起了越来越多研究者们的关注。近日,武汉大学...