1.scRNA-seq识别胶质瘤进展过程中的动态免疫细胞异质性 未成熟的髓系来源细胞可能限制T细胞浸润和活化,导致胶质瘤的免疫抑制。为了研究髓系细胞群的异质性以及在LGG恶性进展过程中TME中这种多样性的功能后果,我们使用了小鼠PDGF-B-驱动的RCAS胶质瘤模型。该模型在大约3 ~ 4周开始形成LGGs,在大约6 ~ 8周进展为HGG...
免疫浸润目的:本研究拟从脓毒性心肌病( Sepsis-induced myocardial dysfunction, SIMD )小鼠心肌组织转录组测序( RNA Sequencing, RNA-Seq)和生物信息学出发,探索脓毒性心肌病的发病机制,核心差异基因及鉴定其相关分子通路,分析坏死性凋亡相关基因的免疫浸润水平,为脓毒性心肌病提供新的研究方向. 方法:在本研究中,将...
首先构建小鼠异位心脏移植模型,同种异体移植组(n=3)和对照组(n=3),然后在小鼠因急性免疫排斥反应死亡之前(第6天)通过流式细胞术分离CD45+细胞,进行scRNA-seq,细胞聚类和细胞类型注释,最后对标记基因鉴定及后续功能分析。 移植组中,B...
基于这些收集的数据集,我们组织了118个比较数据集,这些数据集来自同一scRNA-seq研究中的疾病与正常样本。 CellCommuNet通过CellChat构建了一个由源细胞-靶细胞-配体-受体-信号通路组成的细胞间通讯网络,CellChat是一种利用scRNA-seq数据定量推断细胞间通讯的工具,并使用网络分析和模式识别方法来预测细胞和信号通路如何协调...
为了鉴定内毒素血症小鼠肝脏组织中的新型lncRNAs,作者在指定时间对接受LPS处理的小鼠肝脏进行了高通量RNA序列(RNA-seq)分析(图1A)。根据 Liu 等人的研究 ,作者确定 2、8 和 24 小时这三个时间点可分别揭示内毒素血症不同阶段的炎症反应,包括反应的初始阶段、过渡阶段和随后的恢复阶段。这一选择有助于全面评估内毒...
对相关免疫细胞进行转录组测序(RNA-seq),检测基因表达的差异以及影响的相关通路.结果1.MiR-21-Tg小鼠发生肺脏病变,肺脏中出现淋巴细胞浸润灶和异位生发中心(germinal center,GC);淋巴结和脾脏中浆细胞(plasma cells,PCs)反应性增多(p值均<0.05).2.免疫荧光染色发现miR-21-Tg小鼠淋巴结和脾脏中PCs在滤泡外(...
技术检测对照组及ALI/ARDS组小鼠肺组织]miRNA表达谱的差异,选取其中差异较明显的miRNA通过查询互联网上miRNA靶基因预测软件(TargetScan, miRanda, Clip-seq, miRDB)进行靶基因预测,并以三个或三个以上软件共同预测结果作为microRNA的候选靶基因.将预测的靶基因进行Gene Ontology分析,并用Gather KEGG进行相关信号通路分析...
脓毒症是感染引起免疫系统紊乱而致机体脏器功能损 伤的一种综合征［1°］o 因其危重性、致死性强,而引起公共卫 生的关注。脓毒症可并发脾功能损伤,如脾实质充血、肿 大,嗜中性粒细胞浸润等［］。脾脏作为机体重要的免疫器 官，有清除病原体、异常血液细胞，调节T 、B 细胞等作用。 既往在脓毒症大鼠相关...
(Col1α1)的表达,荧光定量PCR检测肝组织ZFAS1的表达水平,通过siRNA技术在NCTC1469细胞中沉默ZFAS1表达并模拟小鼠肝细胞的纤维化模型,免疫印迹法(Western-blot)检测细胞Col1α1,转化生长因子-β1(TGF-β1),基质金属蛋白酶-2(MMP-2)的表达变化.结果 与对照组比较,CCl4诱导模型组小鼠肝组织内炎性细胞浸润明显,...
对相关免疫细胞进行转录组测序(RNA-seq),检测基因表达的差异以及影响的相关通路.结果1.MiR-21-Tg小鼠发生肺脏病变,肺脏中出现淋巴细胞浸润灶和异位生发中心(germinal center,GC);淋巴结和脾脏中浆细胞(plasma cells,PCs)反应性增多(p值均<0.05).2.免疫荧光染色发现miR-21-Tg小鼠淋巴结和脾脏中PCs在滤泡外(...