对于两个不同物种的定殖实验数据集,机器学习模型均可以基于肠道菌群的初始物种组成来准确预测定殖结果。 图2. 对于来自不同个体的肠道菌群,开展外源物种的定殖实验并对实验结果进行预测。 研究团队通过机器学习模型,开展移除特定物种的假想实验,进一步...
在样本采集方面，研究团队在真实复杂群落中进行定殖抗性的预测，通过自主招募24位志愿者搜集不同种类的肠道菌群，并使用12种不同的抗生素处理方法，得到了超三百个体外培养的肠道菌群样品，并最终通过测序确定定殖结果。团队选择了致病菌屎肠球菌和益生菌嗜黏蛋白阿克曼菌这两类在肠道中常见的外来入侵微生物，在粪便来源...
在该研究中,研究团队提出了微生物生态学的数据驱动的研究范式,通过收集不同微生物群落的组成和外源菌定殖结果作为训练数据,运用机器学习模型准确预测外源物种(致病菌或益生菌)在肠道菌群中的定殖结果,并推断验证了能够显著提高定殖抗性的关键物种。 深圳先进院合成所助理研究员吴璐和哈佛大学博士后王旭文为共同第一作者,...
在该研究中,研究团队提出了微生物生态学的数据驱动的研究范式,通过收集不同微生物群落的组成和外源菌定殖结果作为训练数据,运用机器学习模型准确预测外源物种(致病菌或益生菌)在肠道菌群中的定殖结果,并推断验证了能够显著提高定殖抗性的关键物种。 深圳先进院合成所助理研究员吴璐和哈佛大学博士后王旭文为共同第一作者,...
进一步研究发现,当按蚊体表接触C6-HSL时,能够促进沙雷氏菌在蚊子肠道内的定殖丰度,进而增强其对疟原虫的定殖抗性。因此,C6-HSL这一环境友好的分子为提高共生菌在蚊虫肠道内的定殖能力以及对抗疟原虫感染提供了新方法。例如,我们可以考虑将这...
内源耐药基因和宿主可能是外源耐药基因定殖和加速耐药基因传播的关键。通过结合内源和外源ARGs的研究，可以更好地揭示抗性基因的传播机制和生态影响，明确内源、外源耐药基因对农田环境耐药污染的作用，是农业细菌耐药性发展的重要一环，也能为制定科学的ARGs管理策略提供更全面的理论支持。编辑：张丹丹校对 | 审核：潘...
进一步研究发现,在正常和辣椒疫霉菌胁迫条件下,HK9-3均能稳定定殖在植株根际,进而调节番茄根系构型、提高叶片光合效率和叶片防御酶(POD、SOD、CAT、APX和PAL)活性以及上调PR蛋白和抗氧化相关基因的表达来促进植株的生长并增强番茄对疫霉菌胁迫的抗性。此外,接种HK9-3菌株显著改善了土壤微生态,提高了根际土壤细菌和...
以具有抗腈菌唑标记哈茨木霉TUV-13菌株的分生孢子悬浮液对水稻种子分别进行浸种、蘸根、叶面接种,栽培至2叶1芯期,从秧苗各组织分离回收菌株TUV-13.对经菌液处理的秧苗进行显微及超微观察结果表明,浸种处理能使TUV-13菌株在水稻秧苗的根、茎、叶中稳定定殖;而蘸根处理、叶面接种,TUV-13菌株只能在处理...
以质粒pMarA转入解淀粉芽孢杆菌植生亚种B9601-Y2菌株,获得了卡那霉素抗性标记遗传稳定的 菌株Y2一pMarA。采用浇灌法、拌种法和浸根法接种大白菜,并用浇灌法接种烟草,观察菌株在大白菜和烟草根 部的定殖与消长动态。结果表明:通过10#g/mL卡那霉素的LB平板和PCR方法,证明标记菌株Y2一pMarA ...
[目的]探索供试生防放线菌Actl,Act8和Actl1与生防真菌C,D,M1和M2混合接种对辣椒根系生长,生防菌定殖能力及辣椒叶片和根系诱导抗性的影响.[方法]采用皿内拮抗试验确定适宜的生防真菌与生防放线菌组合,以甜椒和线椒幼苗为供试材料,蘸根接种处理后,于30和31 d时测定生防菌在辣椒根部的定殖量及辣椒叶片和根...