免疫细胞高级孟德尔随机化分析思路 自从10月份开始,免疫细胞孟德尔随机化就开始火起来了,人人都想抢发免疫细胞孟德尔随机化,这个出发点是好的,但是由于学习免疫细胞孟德尔随机化的人太多了, 就会出现严重的烂大街、严重… SCI狂人团队 单细胞转录组+孟德尔随机公开数据集发1区 概普生信 炎症生物标志物与精神分裂症的发生风险:一
文章首先使用基于汇总数据的孟德尔随机化方法(SMR)鉴定精神分裂症风险基因,然后进行了细胞水平和组织水平表达数量性状位点(eQTL)数据的风险基因比较,展示了使用单细胞测序数据的分析可以有效地补充关于精神分裂症风险基因的优势。继而通过表达加权细胞类型富集分析来探索精神分裂症中涉及的脑细胞类型。最后使用STRING构建PPI网络...
一项发表于eBioMedicine期刊的研究,通过单细胞测序和孟德尔随机化(MR)分析,揭示了COVID-19的免疫介导调控机制和潜在药物靶点。研究利用单细胞eQTL(sc-eQTL)和MR结合的方法,从千人基因组计划的单细胞测序数据中筛选出与14种免疫细胞相关的基因表达水平,确定了17,939个有效的eQTL作为MR分析的工具。研究结果发现了132个与...
该研究首次采用孟德尔随机化研究设计来研究肠道微生物群与败血症之间的关系,鉴定了与脓毒症相关的肠道微生物群,包括有益和有害的微生物群落。 2. 单细胞转录组测序联合批量RNA测序,深入机制研究。使用单细胞转录组测序技术分析不同细胞类型的基因表达,深入了解相关基因在脓毒症发展中的功能和调控机制,使用批量RNA测序...
通过将人血浆蛋白质组与基因组数据相结合,进行了蛋白质组范围的孟德尔随机化分析,以系统地识别与结直肠癌风险相关的循环蛋白生物标志物。随后进行了共定位、基于汇总数据的MR和HEIDI测试。采用单细胞类型表达分析检测其在结肠肿瘤组织中的富集细胞类型。最后,进行成药性评价,探讨其作为结直肠癌治疗靶点的潜力。文章整体...
方法通过单细胞转录组测序数据鉴定CRS中的关键细胞亚群。通过高维加权基因共表达网络分析(high dimensional weighted gene co-expression network analysis,hdWGCNA)和多种机器学习算法的联合应用,筛选CRS的关键基因并构建CRS的诊断模型。通过孟德尔随机化和共定位分析进行因果推断分析。使用分子对接技术进行靶点药物的鉴定,并...
摘要 目的:旨在深入探索慢性鼻窦炎(CRS)的分子机制,识别关键细胞亚群和基因,构建有效的诊断模型,并筛选潜在的治疗药物。方法:通过单细胞转录组测序数据鉴定CRS中的关键细胞亚群。通过高维加权基因共表达网络分析(high di...展开更多 Objective To investigate the molecular mechanisms of chronic rhinosinusitis(CRS),to ...
这方面的文章或者研究比较少。两个组学能够联合我能想到的最大的可能性是基因或者细胞,单细胞具备了这两个维度,但是孟德尔随机化本身只是个方法、工具,能拿来的最大可能是QTL,这个技术本身是研究基因、蛋白或者甲基化等内容的,所以最大的可能性是基因,通过基因来跨两个领域。
方法通过单细胞转录组测序数据鉴定CRS中的关键细胞亚群。通过高维加权基因共表达网络分析(high dimensional weighted gene co-expression network analysis,hdWGCNA)和多种机器学习算法的联合应用,筛选CRS的关键基因并构建CRS的诊断模型。通过孟德尔随机化和共定位分析进行因果推断分析。使用分子对接技术进行靶点药物的鉴定,并...
单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术能够揭示细胞水平的异质性,为理解CRS的细胞组成和功能变化提供了更为准确的视角。孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)利用遗传变异作为工具变量,可以揭示特定因素与CRS之间的因果关系,增强遗传因素与CRS关联的认识 [ 5 ] 。共定位分析根据全基因组关联...