1.InSequence：支持多个序列比对到当前基因组，兼容 ab1，seq 等测序文件格式；可视化展示比对结果，错配...
BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）可以说是短序列比对中最常用的比对工具了，它不仅支持核酸和蛋白的双序列比对，而且可以在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较，找到与查询序列相似的序列。NCBI上的在线BLAST具有四种功能模块：Nucleotide BLAST(核酸序列比对到核酸库)、Protein BLAST（蛋白序列比对到蛋白...
提交序列之后,KEGG将会发送邮件确认。 2、邮箱确认 KEGG会给你发邮件(就是你提交序列的时候留下的邮箱号),让你确认是否进行所要求的比对。确认邮件是下面这样的,点击submit即可。 确认后,你的序列比对任务就被提交到KEGG的超算系统了。 3、得到结果并查看 一般序列比对快则几分钟,慢则一个小时(取决于排队的任务数...
在本教程[1]中,我将介绍如何使用最快、最流行的多序列比对工具之一,程序 MAFFT(Katoh 和 Standley 2013)。我将进一步演示如何检测和排除其中核苷酸同源性可能存在问题的比对区域,如何使用公共序列数据库(NCBI 的 GenBank)识别其他同源序列,以及如何使用这些序列来补充现有数据集。 数据集 本教程中使用的数据集是 Mat...
《生物信息学》第三章:序列比较(第三部分)在线多序列比对工具:EMBL-ClustalOmega目前世界上最流行的多序列比对工具是CLUSTAL系列,TCOFFEE和MUSCLE。其中CLUSTAL系列使用率最高;TCOFFEE最新,而且还有很多变形;MUSCLE最快,而且胃口大,能接受的序列数量是其他工具比不了的。各大生物网站,比如EBI、Expasy等都可以在线使用这...
《生物信息学》第三章:序列比较(第三部分) 在线多序列比对工具:EMBL - Clustal Omega 目前世界上最流行的多序列比对工具是 CLUSTAL 系列,TCOFFEE 和 MUSCLE。其中 CLUSTAL 系列使用率最高;TCOFFEE 最新,而且还有很多变形;MUSCLE 最快,而且胃 口大,能接受的序列数量是其他工具比不了的。各大生物网站,比如 EBI、...
clustal序列emblomega工具bioinfo 山东大学基础医学院生物信息学课题组荣誉出品http://.crc.sdu.edu/bioinfo《生物信息学》第三章:序列比较(第三部分)在线多序列比对工具:EMBL-ClustalOmega目前世界上最流行的多序列比对工具是CLUSTAL系列,TCOFFEE和MUSCLE。其中CLUSTAL系列使用率最高;TCOFFEE最新,而且还有很多变形;MUSCLE...
1、山东大学 基础医学院 生物信息学课题组荣誉出品 生物信息学第三章:序列比较(第三部分) 生物信息学第三章:序列比较(第三部分) 在线多序列比对工具:TCOFFEE - Expresso 在线多序列比对工具:TCOFFEE - Expresso TCOFFEE 是一个非常流行的多序列比对工具。TCOFFEE 与 CLUSTAL 系列在所使用 的算法上类似,准确度上...
[31] 3.4 序列两两比较:打点法 1352播放 06:18 [32] 3.4 序列两两比较:打点法 895播放 07:03 [33] 3.5 序列两两比较:序列比对法 860播放 03:30 [34] 3.5 序列两两比较:序列比对法 1589播放 04:33 [35] 3.6 一致度和相似度 1148播放 02:38 [36] 3.7 在线双序列比对工具 817播放 05:51...
[49] 多序列比对介绍 - 1. 用途及算... 1380播放 05:11 [50] 多序列比对介绍 - 2. 注意事项... 2034播放 03:20 [51] 在线多序列比对工具 - 1. EM... 1697播放 待播放 [52] 在线多序列比对工具 - 2. TC... 2008播放 05:16 [53] 在线多序列比对工具 - 3. 多序... ...