第一,编码基因与疾病表型关联数据库,主要提供蛋白质编码基因与人类疾病表型之间关联信息的数据库; 第二,ncRNA与疾病表型关联数据库,主要提供与疾病相关的非编码RNA信息的数据库; 第三,基因组变异与疾病表型关联数据库,主要提供基因组变异信息与疾病的表型相关联信息的数据库; 第四,人群基因组数据库着重于提供世界范围...
国外如英国PAGE研究以及美国哥伦比亚大学的产前WES研究都发布在高水平的期刊杂志上,在这些研究中发现很多基因在胎儿中的表型与出生后的表型并不一致,这也很好理解,毕竟胎儿表型的获得很多时候取决了超声检查,很多细微的改变并不明显,游侠在想这些文章中的表型与基因对应关系可以整理为一个数据库,便于产前WES基因变异...
图丨CRISPRi-seq 全基因组规模基因型 - 表型关联(来源:受访者) “我们首先研究了必需基因,对比单基因敲除数据库,结果显示 62% 已知必需基因敲低后表现出致死表型,93% 已知必需基因敲低后表现出生长缺陷,证明了这一方法的有效性,而且一次实验获得的结果就能够达到单个基因敲除方法 93% 的准确性。” 此外,研究也...
新产品介绍: NHANES是一个美国国家卫生和营养检查调查,收集了大量关于人口统计学、健康状况、营养摄入等方面的数据。这些数据包括临床测量数据、问卷调查数据和生物标本数据。 GWAS数据库则是基于大规模基因组研究的结果,通过分析大量参与者的 - 中科生信于20240204发布
阿斯利康媒体关系部的Slavé Petrovski和同事使用了281104名生物样本库志愿者的全外显子测序数据,评估了罕见蛋白编码变异和超过18500种复杂表型(如哮喘等由多种基因及环境因素影响的疾病)的关系。他们识别出46837个变异水平上和1703个基因水平上的相关,包括此前未知的关联。
而ncRNAVar是一个从文献和研究项目中,系统地收集和整理实验证据支持的各种ncRNA基因变异与疾病表型关联信息的数据库(访问网址:http://lilab2.sysu.edu.cn/ncrnavar/ 或http://www.liwzlab.cn/ncrnavar/)。 接下来,我们从数据和应用层面来分别系统的介绍一下这2个最新的数据库: ...
图丨CRISPRi-seq 全基因组规模基因型 - 表型关联(来源:受访者) “我们首先研究了必需基因,对比单基因敲除数据库,结果显示 62% 已知必需基因敲低后表现出致死表型,93% 已知必需基因敲低后表现出生长缺陷,证明了这一方法的有效性,而且一次实验获得的结果就能够达到单个基因敲除方法 93% 的准确性。” ...