6.g:Profiler,基因富集分析主要用到g:Profiler中的g:GOSt小工具,涉及到的功能注释数据库除了常见的GO和KEGG,还有Reactome、WikiPathways、TRANSFAC、miRTarBase、Human Protein Atlas等。 工具链接: https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/gost 7.WebGestaltWEB-based GEne SeT AnaLysis Toolkit(WebGestalt)是一个综合的功...
Interaction Network Analysis 对于单个基因列表,默认进行富集分析和PP分析,如下所示,输入基因列表,选定物种, 然后点击Express Analysis即可 结果包含以下两种 1. 富集分析的柱状图 默认使用GO, KEGG, Reactome, CORUM等多个数据库进行富集分析,结果如下所示 用柱状图的形式展示top15个显著富集的terms, 示意如下 用网络图...
Interaction Network Analysis 对于单个基因列表,默认进行富集分析和PP分析,如下所示,输入基因列表,选定物种, 然后点击Express Analysis即可 结果包含以下两种 1. 富集分析的柱状图 默认使用GO, KEGG, Reactome, CORUM等多个数据库进行富集分析,结果如下所示 用柱状图的形式展示top15个显著富集的terms, 示意如下 用网络图...