所以,依照这个集成化的规则,我们还不能直接基于表达矩阵,调用Seurat中的函数进行分析。还有进一步利用CreateSeuratObject( )把表达矩阵嵌套进一个Seurat Object类型的变量中,从而满足调用Seurat函数所需要的规则。 Seurat官网在该案例中给出的代码示范如下: # Initialize the Seurat object with the raw (non-normalized ...
对比聚类结果可以发现,RNA与ADT数据组在不同细胞簇上的试别能力有所不同:例如RNA分析在识别祖细胞状态方面,能比ADT分析提供更多信息;而在试别T细胞状态时则相反,ADT分析会优于RNA。 所以,使用多模态分析时,我们需要判断不同数据集对不同细胞簇在识别能力上的强弱;然后,对于特定的细胞簇,如果RNA(或ADT)的识别能...