1.揭示细胞异质性:单细胞RNA测序帮助我们认识到即使在相同组织或器官中,不同细胞之间也可能存在显著的基因表达差异。这有助于理解细胞的特定功能和角色。 2.发现新的细胞类型:通过单细胞RNA测序,科学家们已经发现了一些以前未知的细胞类型,这为生物多样性研究提供了新的视角。 3.疾病研究:单细胞RNA测序可用于研究疾...
单细胞转录组测序(Single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq) 是在单个细胞水平对mRNA 进行高通量测序的一项新技术,其原理是将多细胞生物分离的单个细胞中微量的转录组mRNA 通过高效扩增后再进行高通量测序。单细胞转录组测序能够有效解决组织样本无法破解的细胞异质性难题以及常规RNA-seq 被掩盖的细胞群内的转录组异质性...
一般来说，单细胞RNA测序技术会首先用细胞分选器进行细胞样品分离和抽取，然后用高通量测序（如闪电高通量测序）来检测样品内的基因表达水平。相比传统的RNA表达分析技术，单细胞RNA测序技术具有更高的灵敏度和更宽的动态范围，可以更准确地检测出在原细胞培养体系中不可能或很难被检测出的mRNA表达水平，甚至可以很好地...
为此,研究团队开发出一种高通量、高灵敏度的单细胞核总RNA测序方法用于绘制泛肿瘤单细胞图谱,并探索单细胞核全长转录组测序对于解析肿瘤细胞异质性的价值。 近日,浙江大学郭国骥、王永成、韩晓平、梁廷波、王晶晶团队和浙江省肿瘤医院王长春...
1.2 单细胞RNA测序技术 单细胞RNA测序(scRNA-seq)是一个飞速发展的领域,该技术帮助科研人员从单细胞(single-cell)水平研究基因的表达状态,从而可以更加精细的刻画科研对象的分子状态。目前该领域涌现了一大批用于单细胞RNA测序分析的方法,随着越来越多方法的出现,如何选择和组合使用这些方法组成最佳的分析流程是一个新...
在本研究中[2],作者利用单细胞RNA测序技术绘制水稻幼苗叶片和根系的单细胞转录图谱。作者首先对生长在Kimura B营养液或暴露于各种非生物胁迫下的水稻幼苗的茎和根进行了单细胞RNA测序,并对总共237431个单个细胞的转录组进行了表征。作者分别在叶和根中识别出15和9种细胞类型,并观察到同一组织层的叶和根之间通常共享...
亮点:对7种单细胞(核)RNA测序技术,包括两种低通量的Smart-seq2,CEL-Seq2和五种高通量方法(其中三种基于微液滴技术,Drop-seq,inDrops, 10x-Chromium;一种基于微孔阵列的 Seq-Well和基于组合标记的sci-RNA-seq)进行了直接的分析比较,系统化各项技术的优缺点。
单细胞RNA测序技术现状: 价格昂贵、研究效率低 RNA测序技术发展的本质是分辨率的逐步提升。10年前,科学家进行转录组研究只能通过分离各种细胞群的RNA,利用逆转录酶和标准DNA测序技术来分析每个细胞群的平均转录组。如今,随着测序技术的不断进步,RNA测序已经达到了单细胞水平。借助多种技术分离、标记单个细胞,单细胞RNA测...
表1:单细胞RNA测序技术总览[15] 3.大规模单细胞测序平台 随着单细胞RNA测序技术应用的持续火热,目前出现了一些大规模单细胞测序平台,可以快速、大量的制备单细胞转录组文库并用于下游测序。目前主要的平台包括:10x Chromium Single Cell Gene Expression Solution、BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System、C1™ ...
scm6A-seq技术实现了单细胞内转录组和m6A甲基化组的同时测序(图1),在单个小鼠卵母细胞中可检测到超过一万个基因的表达,鉴定的m6A修饰区域呈现经典的RRAC保守基序特征,且技术重复性良好。通过与公共数据比较,该技术可在筛选到卵母细胞中保守的m6A修饰特征的同时,保留单细胞中的异质性修饰特征。