(蛋白)晶体结构解析常用的一类重要基本方法。对于晶体不对称单位中含有多个结构相同或相似的分子或亚基或不同晶型的品体含有结构相似的分子或亚基的场合此法可由己知分子的结构信息通过分子置换导出相似分子在lH1311胞巾的取向与位片.特点 结合所选参照分子的结构信息,一般先利用帕特逊分子内自身向最峰样由旋转函数确定...
磨刀不误砍柴工,前期阅读教材和文献获得的积累,没有白费,在这个比较艰难的结构解析中派上了用场。case5: 去年我收了一套数据,不到100个氨基酸的蛋白质,1.18埃的数据,多种软件尝试分子置换未果,因为序列同源性太低,使用Blast against PDB直接没有任何hit(No significant similarity found),没有可用的同源...
分子置换法 分子置换法是(蛋白)晶体结构解析常用的一类重要基本方法。如果已知一个结构,就可结合晶体学的结构修正方法求得另外一个未知的结构。这种方法称为分子置换法。对于晶体不对称单位中含有多个结构相同或相似的分子或亚基或不同晶型的品体含有结构相似的分子或亚基的场合此法可由己知分子的结构信息通过分子置换...
经常会听到感慨,比较顺利的分子置换,看到LLG和TFZ比较高,初始修正的R因子等等数据统计指标比较好看,真是很容易。但是有些模凌两可的和比较困难的,就需要基础理论和基础知识以及恒心和毅力,而这些还是来自于对理论基础的理解和软件的熟悉。结构生物学博大精深,我懂得很少,还在不断学习,仅仅分享我的一点心得,供各位参考...
经常会听到感慨,比较顺利的分子置换,看到LLG和TFZ比较高,初始修正的R因子等等数据统计指标比较好看,真是很容易。但是有些模凌两可的和比较困难的,就需要基础理论和基础知识以及恒心和毅力,而这些还是来自于对理论基础的理解和软件的熟悉。结构生物学博大精深,我懂得很少,还在不断学习,仅仅分享我的一点心得,供各位参考...
因此可以采用类似同晶置换的办法解出晶体结构。这种方法称为反常散射法。许多蛋白质分子是由相同或相似的...
分子置换 释义 molecular replacement [医]分子置换;
利用已知结构 1 22 背景 背景 X射线是电磁波 1. 背景:X射线与晶体衍射 • X射线 • 单分子衍射 • 晶体衍射 33 44 背景 背景 X光衍射显微镜(XDM ) 单分子衍射与晶体衍射 Joseph Fourier 1768‐1830 55 ‐ray‐diffraction‐microscopy‐peers‐into‐tiny‐cells 66 1 10/30/2012 分子置换法?
同晶置换法需要制备同晶型的重原子衍生物﹐即在不会改变分子和晶体结构的情况下﹐在晶体中引入一种较重的金属原子。这些金属原子在晶体中以和其它原子相同的周期重复规律排列。它们对于 X射线的散射仅影响晶体的衍射强度﹐而不改变衍射方向。这时重原子的结构振幅可由衍生物与天然晶体衍射强度的差值求得。由于晶体中引...