❝ 这张图理解起来没什么复杂的,就是一个分组提琴图,然后将两个组的小提琴分别显示一半,这样更方便读者直观比较。本小节我们介绍两种实现方法,一种是基于gghalves包中的geom_half_violin函数,另一种是借助github大佬编写的geom_split_violin函数。 ❞ 效果展示 复现效果 ❝ 由于本次使用的数据分布并不是很好,...
legend.title = element_blank()) 先画一下条形图与常规小提琴图方便比较: #用条形图结合误差条图表达数据 P1 <- ggplot(Data_summary,aes(x = Gene, y = Value, fill = Group)) + geom_point(aes(x = Gene, y = Value),pch = 19, position =position_dodge(0.9),size = 2.5) + #绘制均值为...
geom_split_violin(trim= F,color="white",scale = "area") + #绘制分半的小提琴图 geom_point(data = ESTI_Data_summary,aes(x= status, y= score),pch=19, position=position_dodge(0.4),size= 1)+ #绘制均值为点图 geom_errorbar(data = ESTI_Data_summary,aes(ymin = score-ci, ymax= scor...
使用ggplot2库,我们可以轻松地绘制分半小提琴图。首先,我们会绘制出传统的小提琴图,然后通过调整参数来实现分半效果。 # 绘制半小提琴图ggplot(mtcars,aes(x=cyl,y=hp))+geom_violin(trim=FALSE,scale="area",fill="lightblue")+coord_flip()+# 翻转坐标轴theme_minimal()+ggtitle("分半小提琴图示例") 1...
绘图数据的格式准备 加载绘图函数 计算均值和误差 绘制分半小提琴图 用ESTIMATE算法计算免疫得分 参考资料: 《数据可视化——R语言ggplot2包绘制精美的小提琴图》 数据和代码下载:https://gitee.com/ct5869/shengxin-baodian/tree/master/TCGA 作者:赵法明编辑:生信宝典...
下面是paper中的一个图,从图中可以看出,其实也是小提琴图,只不过是两个半面的小提琴图放在了一起。 我们今天就来测试它的画法。 我们从文中下载的所有基因在不同样品中的表达值。 library(ggplot2) library(gghalves) library(tidyverse) data <- read.csv("data.csv",header=T) ...
绘制分半小提琴图 代码语言:javascript 复制 #4.2.出图 # 这个是我自己写的一个ggplot2的主题,可以自定义修改其中的参数if(T){mytheme<-theme(plot.title=element_text(size=12,color="black",hjust=0.5),axis.title=element_text(size=12,color="black"),axis.text=element_text(size=12,color="black")...
1.分半小提琴图 要是有也截一半箱图的函数就更方便了。 geom_violinhalf() flip:TURE时右,FALSE时左。 df_iris<-iris%>%pivot_longer(-Species,names_to="Type",values_to="Length")ggplot(df_iris)+geom_violinhalf(data=filter(df_iris,Species=="virginica"),aes(x=Type,y=Length,fill=Species),...
绘制分半小提琴图 # 4.2. 出图 # 这个是我自己写的一个ggplot2的主题,可以自定义修改其中的参数 if(T){ mytheme <- theme(plot.title = element_text(size = 12,color='black',hjust = 0.5), axis.title = element_text(size = 12,color ='black'), ...
分享Origin绘制半小提琴图!#origin绘图 #origin #科研绘图 #研究生 #科研工具 #科研 - 一名埋头苦干的博士僧于20221122发布在抖音,已经收获了23.4万个喜欢,来抖音,记录美好生活!