一、元基因组学技术的原理 元基因组学技术主要是基于两种顺序技术:454测序和Illumina测序。这两项测序技术都可以非常准确地分析样品中的所有DNA序列,并将其作为测序结果输出。 在进行元基因组学测序时,通常需要考虑几个因素:DNA提纯,DNA片段化、修饰和连接、测序方法和测序深度。这些基础技术将被用来获得高质量的元基...
元基因组学技术 ——大片段文库的构建 朱雅新 zhuyx@Im.ac.cn 微生物前期开发国家重点实验室 2012-3-29 微生物所十二讲 测试技术论坛 提纲 ? 直接针对特定生境中宏量生物信息(DNA.mRNA.micRNA.蛋白等)的研 究技术在近年来发展迅速,元基因组技术是重要的基础之一,该技术 通过分析微生物种群生态分布、群体遗传特...
宏基因组学作为一种新的微生物研究方法,是指以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象,利用新一代高通量测序技术(NGS)研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等,是近年来热门且活跃的一个研究领域。宏基因组学的应用场景覆盖微生态学、海洋微生物资源开发、环境保护和污染修复、医学领域...
近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心建立了拉曼介导的靶向元基因组技术(Ramanome-Guided Metagenomics;RGM),RGM首先通过单细胞拉曼光谱表征与识别细胞原位固碳功能,然后准确地分选出特定固碳功能的单细胞,并与基因组测序相耦合。由于其不依赖于细胞培养而且不需荧光标记细胞,因此RGM技术为海洋微生物组原位...
在这里,我们介绍了一种新颖的实验和生物信息学框架metaSort,用于从宏基因组学样本中有效构建细菌基因组。 MetaSort提供了一种基于流式细胞仪和单细胞测序方法的分类微型元基因组方法,并采用新的计算算法,通过原始元基因组的补充,从分类后的微型元基因组中有效地回收了高质量的基因组。 通过对模拟数据集,唾液和肠道微...
MetaMIS是在宏基因组学领域自动推断微生物群落概况的微生物相互作用的第一个工具。 MetaMIS的最显着特征是它能够在生态互动网络中保留最大数量的稀有物种。 MetaMIS为没有编程技能的科学家提供了用户友好的交互式独立图形界面,以研究微生物之间的相互作用。 2017.03.09 MetaMIS_v1.02:-创建用于导出共识表的选项。
人类约有5万种基因,但是目前被确认的只有2,200多种。全世界的科学家开始了雄心勃勃的进军,希望在15年内,耗资30亿美元,完成“人类基因组规划”。可以预言,一旦描绘出“人类基因组”蓝图,医生给我们看病所使用的治疗手段,将超出任何人的想象。与此同时,生物学家也在发动一场生物技术革命,他们借鉴“人类基因组规划...
目前,基于长读长测序的靶向测序技术正被用于研究多种神经退行性疾病中的重复性元素变异,提供变异结构的精确描述。随着成本的进一步降低,预计队列级全基因组 LRS 将进一步扩大神经退行性疾病的候选重复元件变异列表。除测序技术外,人工智能的快速发展也将加深人们对神经退行性疾病中重复元件变异的生物学意义的理解。近年来...
基因组编辑技术的不断发展为治疗一直难以解决的疾病提供了新的可能性,其中包括新型的细胞和基因疗法。像Tome Biosciences这样的公司是新一波初创公司中的一员,它们正在构建利用CRISPR/Cas9和其他基因组编辑技术的商业平台。 基因组编辑技术的不断发展为治疗一直难以解决的疾病提供了新的可能性,其中包括新型的细胞和基因疗...
据TechCrunch报道,在生物技术和制药研究领域,对基因组数据的需求持续上升,但成本仍然是一个因素--即使是全基因组测序,现在也只需要1000美元。但是,Ultima Genomics公司声称将这一成本再降低一个数量级至100美元,它甚至可能进一步加速这一经济。 Ultima公司称,其测序机器和软件平台UG 100可以在大约20小时内完成人类基因组...