近日,化学学院李峰教授团队开发了一种基于深度学习的质谱谱图预测技术(DeepCDM),利用迁移学习和包含少量实验谱图的训练集,成功将通用性的谱图预测工具转化为针对CDM的专用预测算法,大大提升了CDM质谱谱图预测的准确性。基于DeepCDM,构建了丹磺酰化...
一、修饰位点的识别 在质谱图上,修饰通常表现为在特定残基上的质量移位。例如,磷酸化修饰会在带有修饰的肽段的m/z值上增加约80 Da。这种质量差是由于磷酸基团的添加。如果你在质谱图上看到了质量差,你就可以推测可能发生了修饰。然后,你可以通过查看哪些残基在这种质量差下可能发生修饰来进一步确定。在磷酸化的例子...
一、分析质谱图 1.观察峰值: 质谱图中的峰值代表了不同质量的离子。氨基酸残基的质量可以帮助我们确定组成蛋白质的氨基酸类型。 2.计算质量差异: 观察相邻峰值间的质量差异,这有助于识别特定的氨基酸残基。每种氨基酸有其特定的质量差。 3.对照氨基酸质量表: ...
使用传统的序列搜库方法成功鉴定出的质谱和相关肽段的数据量在飞速增长,这种主流方法是已使用近20年的经典方法:采用胰蛋白酶消化所提取的蛋白质得到肽段,然后通过串联质谱法产生肽的串联质谱[10],接着将谱图与蛋白质序列数据库进行匹配计算,以判断该质谱是否由某肽段所产生,最终获得肽和蛋白质的鉴定。虽然这个过程...
Cordraw,PPT在质谱图解析与美化中的应用 讲课人:张洪涛 桌布的设置 点击这个位置,就可以出现所有的桌布设置格式,选择即可,比如我们选择A4 桌布的高级设置 点击这个位置,就可以使用鼠标的拖拉功能和选择等功能 点击鼠标左键,拖拉想要选中的区域,就可以成功选择 点击鼠标右键,会出现选择区域,ungroup表示将你所选中...
确认的办法是看最大的碎片和第二大的碎片的差值是否合理.多数减15,也有减18或43,这样看具体情况.如果有这样的碎片就认为是分子离子峰的可能性很大.然后再看基峰.基峰是质谱图二维结构中的纵向看法.从基峰来判断物质最为稳定的碎片是不是和你想象的相同,以此为基础增减碎片来判断其它的可能结构....
本文就报道了一种策略,将能够高通量预测修饰位点的tRNA-seq和RNA质谱相结合,实现了对霍乱弧菌——一种tRNA修饰谱图尚未被表征的病原菌进行了tRNA修饰位点的预测。在tRNA-seq的结果中,通过将霍乱弧菌与大肠杆菌的tRNA修饰谱图相比较,作者...
齐岳ICG NHS ester 活化羧基修饰吲哚菁绿,血管造影成像活化脂吲哚菁绿质谱检测图谱 ICG NHS ester 吲哚菁绿琥珀酰亚胺脂 外观:暗棕红色粉末 溶解度:在水或甲醇中溶解 纯度:90%+ 结构式: 产品简介:ICG-NHS酯是一种具有具代表性的NHS酯标记胺反应基团的产物。由于它对一级胺(-NH2)具有快速、高特异性的反应,能...
楼主,问题解决了没?金颗粒的分子量都几十K,2nm左右金颗粒都接近20K,你这图谱范围太小了吧,连上...
蛋白质组学+代谢组学 翻译后修饰蛋白质组+代谢组 转录组学+脂质组学 生物制药分析 非变性质谱分析(Native MS) 抗体偶联药物(ADCs)分析 蛋白质纯度分析(分子筛/反相色谱) 生物药二硫键/游离半胱氨酸检测 肽段覆盖率/肽谱图分析 SDS-PAGE蛋白质纯度分析 高分辨质谱分子量鉴定 抗体C端K缺失比例分析 MALDI ...