提取该蛋白质结构的所有序列 save 1ywt.fasta 仅提取该蛋白质结构的特定chain的序列 save 1ywt.fasta, chain A 方法(2)使用网页在线数据库的方法 https://swift.cmbi.umcn.nl/servers/html/soupir.html 简单两步,就可以得到如下的结果
你是想把蛋白的序列提取出来是吗,可以用perl写个脚本,先一个一个的打开pdb文件,然后读出以SEQRES开头的行,并写入到一个新的文件中。
从pdb文件中提取蛋白质序列 方法(1)使用pymol的方法 pymol的下载安装使用方法在教程已经叙述过了 提取该蛋白质结构的所有序列 save 1ywt.fasta 仅提取该蛋白质结构的特定chain的序列 save 1ywt.fasta, chain A 方法(2)使用网页在线数据库的方法 https://swift.cmbi.umcn.nl/servers/html/soupir.html 简单两步...