rmsd代表均方根偏差,是衡量两个结构之间差异程度的一种方法,较小的rmsd值表示结构相似性较高,较大的rmsd值表示结构差异性较大。 rmsd值的基本定义 RMSD(Root Mean Square Deviation),即均方根偏差,是一种广泛用于衡量两组数据点或两个结构之间差异程度的统计量。在化学、生物学...
什么是RMSD RMSF BioDoge 卷起来39 人赞同了该文章 RMSD,Root Mean Square Deviation,均方根偏差;RMSF,Root Mean Square Fluctuation,均方根波动。在轨迹分析中,最经常用,最简单,也最有用的就是这两巨头,二者都是对位移的平方和再求平方根,最后求得均值。其实差别就在于,这个“均值”是哪个物理量按照什么的平均...
RMSD 英文全称Royal Mail Special Delivery 中文解释皇家邮政专递 缩写分类社科总论,常用词汇 TDC(香港)贸易发展局 TDR国库券存据 Tech技术的 Tel.电话号码 telecom通讯 TESSA免税特别储蓄帐户 TEU(货柜、集装箱)20英尺当量单位 TF贸易融资 t.f.直到取消为止...
分子对接rmsd能说明RMSD值是两个分子之间(或者同一个分子的两个状态之间)的结构差异。分子对接方面则经常把结晶在蛋白质上的配体提取出来,拿对接软件再对接回去,然后比较对接前后的两个配体之间的RMSD值,这个值越小,说明对接软件的准确性更高。一般而言是看前者的,因为前者是总能量,后者是相互作用...
RMSD是对原子总数求平均,RMSF是对时间求平均,下面有个网站你可以看看 http://junnys.bokee.com/...
the root-mean-square deviation (rmsd):均方根差,近期看了篇蛋白质进入碳纳米管的文章,里面有一个蛋白质的rmsd示意图,用的软件是namd, 我想问一下,这里的均方根差代表的物理图像是什么啊,指的是蛋白质质心运动对蛋白质质心坐标平均值的离散度,还是各蛋白质残基坐标对质心的坐标离散度啊? 谢谢参与和指点啊...
rmsd值相差不大,说明在该价eeev(1)态下,铁离子能与配基小分子形成稳定的配位结构。rmssd正常范围是(27±12)ms,这个数值是属于24小时分析的情况。rmssd是属于对心率变异性的分析其中的一个数值,还包括其他两项数值,分别为SDNN和SDANN,正常范围分别是(141±39)ms和(127±35)ms,通过这三个数值...
此处的RMSD是对模拟过程中压力波动而言的,和轨迹分析对几何结构计算的RMSD完全是两码事 当前没必然异常 ...