KEGG是代谢通路图,得到的是一张展示各个基因或物质关系的网状图。例如通过KEGG分析后得到其中一条富集通路的编号是map00010(糖酵解/糖异生),则可以认为所研究的现象的机制与糖酵解/糖异生有关。同样,可能很多个基因会被富集在同一条通路中,而也有可能很多个基因没有被富集到,所以差异基因的个数与KEGG富集结果也不是一一对应的关系。
GO和KEGG富集分析是两种基于不同数据库的生物信息学方法,用于解析基因或蛋白集合在功能、代谢途径等层面的生物学意义。GO分析聚焦基因功能的分类与层级关系,而KEGG分析侧重基因在生物网络中的相互作用与通路关联。两者相辅相成,共同揭示基因集合的潜在机制。 一、GO富集分析的功能解...
GO和KEGG富集分析是生物信息学中两种重要的数据分析方法,它们能够帮助研究人员深入了解基因集合在特定实验条件或生物学背景下的功能、通路或特定生物学过程的富集程度。下面我来详细解释一下这两种方法: GO富集分析 定义:GO(Gene Ontology)富集分析是一种基于GO数据库的功能注释和分类方法。GO数据库将基因和蛋白质的功能...
KEGG富集分析通过比对基因与KEGG数据库中的通路，确定哪些通路有显著的基因富集，侧重于代谢通路的研究。
和KEGG和GO分析有什么区别? 我们前面 但是,一般的差异分析(GO和Pathway)往往侧重于比较两组间的基因表达差异,集中关注少数几个显著上调或下调的基因,这容易遗漏部分差异表达不显著却有重要生物学意义的基因,忽略一些基因的生物特性、基因调控网络之间的关系及基因功能和意义等有价值的信息。而GSEA不需要指定明确的差异...
你是否对富集分析感到困惑?GO和KEGG究竟有什么不同?这期视频,我们将用简单易懂的方式为你解读富集分析的概念,并深入浅出地讲解GO和KEGG这两大常用数据库的区别。无论你是生信新手还是对基因研究感兴趣,这个视频都能帮助你轻松掌握这些重要的知识点!健康科普一夏 科普 入门 视频教程 医学生 新手 经验分享 科研 ...
GO、KEGG、GSEA是单细胞测序数据解析的三个高级分析工具，它们各自有独特的功能与应用领域。GO数据库对基因产物进行标准化描述，包含细胞组分、分子功能、生物过程三个维度，GO富集分析则能揭示差异基因在哪些生物学功能、途径或细胞定位上富集，提供基因功能注释。KEGG强调网状代谢通路研究，由前期研究发现的...
富集分析是什么?GO vs KEGG:初中生都能看懂!富集分析是什么?GO vs KEGG:初中生都能看懂!大家好我叫Peter编辑于 2025年02月20日 21:06 把差异基因进行富集,对应已知/未知功能群推测因素改变→差异基因→相关功能 分享至 投诉或建议评论 赞与转发1 0 0 0 0 回到旧版 顶部登录哔哩哔哩,高清视频免费看!
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