中国农业科学院郑州果树研究所研究团队选取猕猴桃耐涝基因型KR5为研究材料,结合三代SMRT测序和二代测序进行了转录组分析,揭示了猕猴桃的耐涝机制,并在《International Journal of Molecular Sciences》(IF=6.208/化学2区)期刊上发表了题为“Full-Length Transcriptome and RNA-Seq Analy
中国农业科学院郑州果树研究所研究团队选取猕猴桃耐涝基因型KR5为研究材料,结合三代SMRT测序和二代测序进行了转录组分析,揭示了猕猴桃的耐涝机制,并在《International Journal of Molecular Sciences》(IF=6.208/化学2区)期刊上发表了题为“Full-Length Transcriptome and RNA-Seq Analyses Reveal the Mechanisms Underlying...
听销售说有二代、三代技术，这两有什么区别呢？二代转录组目前来说就是illumina测序仪做的，价格便宜...
本发明涉及基因组注释技术领域,提供一种利用二代和三代转录组测序数据的基因组注释方法。本发明的方法包括下述步骤:步骤1:将三代全长转录组测序序列比对到目标基因组,得到各编码基因的初始结构信息;步骤2:将二代转录组测序短序列比对到目标基因组,从比对文件中提取内含子剪切位点信息;步骤3:结合各编码基因的初始结构...
基于转录组数据预测编码基因的方法中,比较有代表性的有pasa、tophat+cufflinks、hisat2+stringtie等。二代和三代转录组测序数据都可以作为pasa的输入。三代全长转录组因为无须组装即可得到转录本的全长序列,具有准确可靠的优点。通常三代数据可以直接输入给pasa,二代数据则需先用组装软件如trinity组装后才能输入。而to...
奥维森提供了三代全长和二代转录组测序及分析服务。 01 研究背景 在淹水的土壤中,根组织被淹没在水中,导致根际周围的氧气浓度迅速下降。缺氧限制了根部的有氧呼吸,导致能量不足,对植物生长发育造成伤害。猕猴桃具有耐涝性,然而,这一特征背后的机制尚不清楚。