`--only-flank`:只提取侧翼序列,不包含bed的区间序列。 `--threads`:线程数,用于加速处理。 `-w`:提取序列的单行宽度,0表示单行。 `--up-stream`:提取上游序列区间长度,这里是1500bp。 `--down-stream`:提取下游序列区间长度,虽然这里没有用到,但可以作为参数保留。 `--bed`:指定BED文件。 `-o`:指定...
在典型的基因中，基因上游指的是编码链的5'端位置。这一概念通常用来描述与RNA聚合酶结合的区域，因此包含了启动子等非编码区序列。启动子位于基因上游，是调控基因转录起始的关键区域。基因上游具体是指DNA链中能够与RNA聚合酶结合的那部分，而RNA的转录则是从模板链的3'向5'方向进行的。由于DNA是双...
在大多数原核基因的转录起始位点上游-10区,存在一个保守的序列模体TATAAT,也被称为Pribnow box或-10序列。这个序列在大肠杆菌中最常见,但在其他原核生物中也有一定的保守性。Pribnow box的保守性是指其中的每个碱基对偶具有一定的保守性,比如TATAAT序列中的A、T和A等碱基。 Pribnow box是转录因子结合的重要位点。
上游激活序列 上游激活序列是真核基因中一类顺式调控序列，通常被认为与增强子相关，临近TATA box的上游，可以结合转录激活子 英文：upstream activating sequence,UAS
答: (1)启动子内部的突变会增强或降低转录水平。 (2)同启动子有关,下游序列同转录. 的方向一致;上游序列同转录方向相反。结果一 题目 区别(1)启动子增效突变与启动子减效突变;(2)上游序列和下游序列。 答案 答:(1)启动子内部的突变会增强或降低转录水平。(2)同启动子有关,下游序列同转录.的方向一致;上游...
在本课程中,我们经常提到序列的“上游”或“下游”。上游是指以某段序列或某个点为基准,往5’端的序列称为上游序列,反之,靠近3'端的序列称为下游序列。所以“上游”和“下游”是相对而言的。 A.正确B.错误相关知识点: 试题来源: 解析 A 反馈 收藏 ...
上游序列 释义 upstream sequence 上游序列; 行业词典 生物化学 upstream sequence
上游表达序列 上游表达序列是2007年公布的遗传学名词。定义 酵母基因转录的调控元件之一，位于结构基因5'端上游。出处 《遗传学名词》。
--only-flank 只提取侧翼序列,不包含bed的区间序列 --threads 线程数 -w 提取序列的单行宽度。0表示单行。 --up-stream 提取上游序列区间长度 --down-stream 提取下游序列区间长度 --bed 指定bed文件 -o 指定输出结果文件。当输出文件添加后缀.gz 时,即可得到压缩的输出结果文件。 命令接受输入文件为压缩格式。